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第一章緒論
一、術(shù)語或名詞
1 微生物(microorganism) 因太小，一般用肉眼看不清楚的生物。這些微小生物包括：無細胞結(jié)構(gòu)不能獨立生活的病毒、亞病毒(類病毒、擬病毒、朊病毒)；具原核細胞結(jié)構(gòu)的真細菌、古生菌以及具真核細胞結(jié)構(gòu)的真菌(酵母、霉菌、蕈菌等)、單細胞藻類、原生動物等。但其中也有少數(shù)成員是肉眼可見的。
2 微生物學(xué)(microbiology) 研究肉眼難以看清的稱之為微生物的生命活動的科學(xué)，分離和培養(yǎng)這些微小生物需要特殊技術(shù)。
3 分子微生物學(xué)(molecular microbiology) 在分子水平上研究微生物生命活動規(guī)律的科學(xué)。
4 細胞微生物學(xué)(cellular microbiology) 重點研究微生物與寄主細胞相互關(guān)系的科學(xué)。
5 微生物基因組學(xué)(microbic genomics) 研究微生物基因組的分子結(jié)構(gòu)、信息含量及其編碼的基因產(chǎn)物的科學(xué)。
6 自生說(spontaneous generation) 一個古老的學(xué)說，認為一切生命有機體能夠從無生命的物質(zhì)自然發(fā)生的。
7 安東·列文虎克(AntonyvanLeeuwenhoek，1632—1723) 荷蘭商人，他是真正看見并描述微生物的第一人，他利用自制放大倍數(shù)為50～300倍的顯微鏡發(fā)現(xiàn)了微生物世界(當時被稱之為微小動物)，首次揭示了一個嶄新的生物世界——微生物界。
8 路易斯·巴斯德(Louis Pasteur) 法國人，1822—1895，原為化學(xué)家，后來轉(zhuǎn)向微生物學(xué)研究領(lǐng)域，為微生物學(xué)的建立和發(fā)展做出了卓越的貢獻，成為微生物學(xué)的奠基人。主要貢獻：用曲頸瓶實驗徹底否定了“自生說”，從此建立了病原學(xué)說，推動了微生物學(xué)的發(fā)展；研究了雞霍亂，發(fā)現(xiàn)將病原菌減毒可誘發(fā)免疫性，以預(yù)防雞霍亂�。黄浜笏盅芯苛伺！⒀蛱烤也『涂袢。⑹状沃瞥煽袢呙纾C實其免疫學(xué)說，為人類防病、治病做出了重大貢獻；分離到了許多引起發(fā)酵的微生物，并證實酒精發(fā)酵是由酵母菌引起的，也發(fā)現(xiàn)乳酸發(fā)酵、醋酸發(fā)酵和丁酸發(fā)酵都是不同細菌所引起的，為進一步研究微生物的生理生化和工業(yè)微生物學(xué)奠定了基礎(chǔ)。
9 羅伯特柯赫(Robert Koch) 德國人，1843—1910，著名的細菌學(xué)家，曾經(jīng)是一名醫(yī)生，對病原細菌的研究做出了突出的貢獻：A具體證實了炭疽病菌是炭疽病的病原菌；B分離、培養(yǎng)了肺結(jié)核病的病原菌，這是當時死亡率極高的傳染性疾病，因此柯赫獲得了諾貝爾獎；C提出了證明某種微生物是否為某種疾病病原體的基本原則——柯赫氏定律。他也是微生物學(xué)的奠基人。
10伍連德(1879—1960)我國廣東香山人，著名公共衛(wèi)生學(xué)家，我國海港檢疫創(chuàng)始人。他用微生物學(xué)理論和技術(shù)對鼠疫和霍亂的病原進行研究和防治，在中國最早建立起衛(wèi)生防疫機構(gòu)，培養(yǎng)了第一支預(yù)防鼠疫的專業(yè)隊伍，在他的領(lǐng)導(dǎo)和組織下，有效地戰(zhàn)勝了1910—1911和1920—1921年間我國東北各地鼠疫的大流行，被國際上譽為著名的防疫專家，世界鼠疫會議1911年4月在我國沈陽舉行時，他任大會主席和中國首席代表。著有“論肺型鼠疫”、“鼠疫概論”和“中國醫(yī)史”等。
11湯飛凡(1879—1958) 我國湖南醴陵人，著名的醫(yī)學(xué)微生物學(xué)家，在醫(yī)學(xué)細菌學(xué)、病毒學(xué)和免疫學(xué)等方面的某些領(lǐng)域做出·了顯著的貢獻，特別是首次應(yīng)用雞胚卵黃囊接種法從病人的眼結(jié)膜刮屑物中分離、培養(yǎng)沙眼衣原體的成功，確證了沙眼衣原體的存在，為世界上首創(chuàng)，成為醫(yī)學(xué)微生物學(xué)方面的重大成果。
12SARS Severe Acute Respiratory Syndrome的簡稱，嚴重急性呼吸道綜合征，即我國稱為的非典型肺炎，也簡稱為非典。
第二章 微生物的純培養(yǎng)和顯微鏡技術(shù)
一、術(shù)語或名詞
1 菌落(colony) 單個微生物細胞在適宜的固體培養(yǎng)基表面或內(nèi)部生長、繁殖到——定程度形成的肉眼可見的、有一定形態(tài)結(jié)構(gòu)的子細胞生長群體。
2 菌苔(lawn) 固體培養(yǎng)基表面眾多菌落連成一片時所形成的微生物生長群體。
3 平皿(Petri dish) 由玻璃或透明塑料制成的圓形皿底和皿蓋組成，皿蓋可覆蓋于皿底之 上，防止空氣中微生物的污染。其英文名稱是為紀念其發(fā)明者Richard Petri。
4 純培養(yǎng)物(pure culture) 由一種微生物組成的細胞群體，通常是由一個單細胞生長、繁殖所形成。
5 培養(yǎng)基(culture medium) 供微生物生長、繁殖的營養(yǎng)基質(zhì)，根據(jù)其中固化劑含量的不同可分為固體、半固體、液體3種。
6 無菌技術(shù)(aseptic technique) 在分離、轉(zhuǎn)接及培養(yǎng)純種微生物時，防止其被環(huán)境中微生物污染或其自身污染環(huán)境的技術(shù)。
7 培養(yǎng)平板(culture plate) 常簡稱為平板，指固體培養(yǎng)基倒人無菌平皿，冷卻凝固后所形成的培養(yǎng)基平面。
8 稀釋倒平板法(pour plate method) 將待分離的材料稀釋后與已熔化并冷卻至50℃左右的瓊脂培養(yǎng)基混合，搖勻后制成可能含菌的培養(yǎng)平板，保溫培養(yǎng)后分離得到的微生物菌落生長在固體培養(yǎng)基表面和里面。
9 涂布平板法(spread plate method) 在培養(yǎng)平板表面均勻涂布經(jīng)過稀釋的微生物懸液后，保溫培養(yǎng)，在固體培養(yǎng)基表面得到生長分離的微生物菌落。
10 平板劃線法(streak plate method) 用接種環(huán)在培養(yǎng)平板表面劃線接種微生物，使微生物細胞數(shù)量隨著劃線次數(shù)的增加而減少，并逐步分開。保溫培養(yǎng)后，在固體培養(yǎng)基表面得到生長分離的微生物菌落。
11 稀釋搖管法(dilution shake culture method) 將待分離的材料稀釋后與已熔化并冷卻至50~C左右的瓊脂培養(yǎng)基混合，搖勻后用石蠟封蓋，保溫培養(yǎng)后分離得到的微生物菌落生長在瓊脂柱中間。
12 單細胞分離法(single cell pickup method) 采用顯微操作技術(shù)直接挑取微生物的單細胞(孢子)，培養(yǎng)后獲得純培養(yǎng)物。
13 富集培養(yǎng)(enrichment culture) 利用不同微生物間生命活動特點的不同，制定特定的環(huán)境條件，使僅適應(yīng)于該條件的微生物旺盛生長，從而使其在群落中的數(shù)量大大增加，從自然界中分離到所需的特定微生物。
14 二元培養(yǎng)物(two—component culture) 由兩種具有特定關(guān)系(例如寄生或捕食)的微生 物組成的混合培養(yǎng)物。
15 原子力顯微鏡(Atomic Force Microscope AFM) 掃描探針顯微鏡的一種，利用細小的探針對樣品表面進行恒定高度的掃描，同時通過一個激光裝置來監(jiān)測探針隨樣品表面的升降變化來獲取樣品表面形貌的信息。
16 明視野顯微鏡(bright—field microscope) 這種顯微鏡的照明方式為透射照明，即光線直接進入視野，在一個相對明亮的背景中形成一個暗的物像。
17 聚焦掃描激光顯微鏡(confocal scanning laser microscope，CSLM) 這種顯微鏡采用激光作為光源，每次僅對一個點進行照射，從而大大減少樣品其他部分發(fā)出的雜散光的干擾。觀察時通過激光器或載物臺掃描，計算機處理，最終獲得反差鮮明、高分辨率的三維立體數(shù)字圖像。
18 熒光顯微鏡(fluorescence microscope) 這種顯微鏡用紫外線或藍紫光照射經(jīng)過熒光染料染色的樣品，然后觀察激發(fā)出的熒光所形成的物像。
19 數(shù)值孔徑(numerical aperture) 決定顯微鏡物鏡分辨率性能物理指標，取決于物鏡的鏡口角和玻片與鏡頭間介質(zhì)的折射率。
20 相差顯微鏡(phase—contrast microscope) 這種光學(xué)顯微鏡通過特殊的裝置把樣品不同部位間折射率和細胞密度的微弱差異轉(zhuǎn)變?yōu)槿搜劭梢圆煊X的明暗差，可在不染色的情況下對透明的活細胞及其內(nèi)部結(jié)構(gòu)進行直接觀察。
21 分辨率(resolution) 能辨析兩點之間最小距離的能力，距離越小，分辨率越高。
22 掃描電子顯微鏡(scanning electron microscope，SEM) 這種電子顯微鏡用電子束掃描樣品表面，收集從表面發(fā)出的二次電子形成樣品的表面圖像。
23 掃描探針顯微鏡(scanning probe microscope) 通過在物體表面移動一種敏銳的探針來研究表面特征的顯微鏡(如掃描隧道顯微鏡)。
24 掃描隧道顯微鏡(scanning tunneling microscope) 掃描探針顯微鏡的一種，用細小的探針在樣品表面進行掃描，通過檢測針尖和樣品間隧道效應(yīng)電流的變化形成物像。
25 透射電子顯微鏡(transmission electron microscope) 這種顯微鏡用電子束透射樣品，用磁透鏡使散射的電子聚焦成像。
26 反差(contrast) 被觀察物區(qū)別于背景的程度。
27 暗視野顯微鏡(dark—field microscope) 這種顯微鏡利用特殊的聚光器進行斜射照明，經(jīng)樣品反射或折射的光線進入物鏡成像。
28 固定(fixation) 制樣過程中使整個機體及其細胞的內(nèi)、外結(jié)構(gòu)被保存并固定在適當位置的過程。
29 負染色(negative staining) 染料使背景顏色加深而樣品沒有著色的染色法。
30 菌絲體(mycelium) 聚成一團的分支菌絲，見于真菌和某些細菌。
31 菌絲(hypha) 大多數(shù)霉菌和某些細菌的結(jié)構(gòu)單位，管形絲狀體。
32 雙球菌(diplococcus) 分裂后成對排列的球菌。
33 球菌(COCCUS) 細胞大致呈球狀的細菌。
34 螺菌(spirillum) 剛性的螺旋狀細菌。
35 螺旋體(spirochete) 柔韌的螺旋狀細菌，具有周質(zhì)鞭毛。
36 桿菌(rod) 細胞呈桿狀的細菌。
37 柄細菌(prosthecate bacteria) 細胞上有柄、菌絲、附器等細胞質(zhì)伸出物，細胞呈桿狀或梭狀，并有特征性細柄的細菌。
38 霉菌(mold) 以多細胞絲狀群體形式生存的真菌。
39 真菌(fungi) 有線粒體，無葉綠體，沒有根、莖、葉分化，以無性和有性孢子進行繁殖的真核微生物。
40 酵母菌(yeast) 單細胞真菌。
41 藻類(algae) 能進行光合作用的真核微生物。
42 原生動物(prokaryote) 缺少真正細胞壁，具有運動能力，進行吞噬營養(yǎng)的單細胞真核微生物。
第三章 微生物細胞的結(jié)構(gòu)與功能
一、術(shù)語或名詞
1 原核生物(proksryotes) 一大類細胞微小、只有稱作核區(qū)(無細胞膜包裹的裸露DNA)的原核單細胞生物。所有原核生物都是微生物，包括真細菌和古生菌兩大類群。原核生物與真核生物的主要區(qū)別是：①基因組由無核膜包裹的雙鏈DNA環(huán)組成。②缺少單位膜分隔而成的細胞器。③核糖體為70S型。
2 細菌細胞壁(ceUWaU ofbacteris) 位于細菌細胞最外面的一層厚實、堅韌的外被，主要由肽聚糖組成，有固定細胞外形和保護細胞免受損傷等多種功能。革蘭氏陽性細菌細胞壁的特點是厚度大(20—80rim)和化學(xué)組分簡單，一般只含90％肽聚糖和10％磷壁酸。革蘭氏陰性細菌的細胞壁由外膜(含脂多糖、磷脂和外膜蛋白)和一薄層肽聚糖(2～3am)組成。
3 肽聚糖(peptidoglycan) 真細菌細胞壁的特有成分，由無數(shù)肽聚糖單體以網(wǎng)狀形式交聯(lián)而成。肽聚糖單體由肽與聚糖兩部分構(gòu)成，其中的肽由四肽尾和肽橋構(gòu)成，聚糖則由N—乙酰葡糖胺和／V—乙酰胞壁酸以"—1，4糖苷鍵相互間隔交聯(lián)而成，呈長鏈骨架狀。C’細菌的四肽尾一般由L—Ala、D—Glu、L—Lys和D—Ala 4個氨基酸構(gòu)成，肽橋則由5個Gly殘基構(gòu)成；C—細菌的四肽尾一般由L—Ala、D—Glu、m—DAP和D—Ala構(gòu)成，且無肽橋。
4 磷壁酸(teichoicacid) G’細菌細胞壁上的一種酸性多糖，主要成分為甘油磷酸或核糖醇磷酸�？煞直诹妆谒岷湍ち妆谒醿煞N，前者是與肽聚糖分子間進行共價結(jié)合的磷壁酸，后者則是跨越肽聚糖層并與細胞膜相交聯(lián)的磷壁酸。
5 外膜(outer membrane) 位于G—細菌細胞壁最外層的一層由脂多糖(LPS)、磷脂、脂蛋白和其他蛋白組成的厚膜。
6 脂多糖(lipopolysaccharide，LPS) 位于C—細菌細胞壁最外層的一層較厚(8—10nm)的類脂多糖類物質(zhì)，由類脂A、核心多糖和O—特異側(cè)鏈3部分構(gòu)成，是C—細菌致病物質(zhì)內(nèi)毒素的成分。
7 外膜蛋白(outer membrane protein)嵌合在C—細菌細胞壁外膜上的多種蛋白質(zhì)成分，如脂蛋白和孔蛋白等。
8 周質(zhì)空間(periplasmicspace) 一般指位于C—細菌細胞壁外膜與細胞膜之間的狹窄空間，呈膠狀，內(nèi)含各種周質(zhì)蛋白，包括各種酶類和受體蛋白等。
9 假肽聚糖(pseudopeptidoglycan) 甲烷桿菌屬(Methanobacterium)等部分古生菌細胞壁的主要成分。其多糖骨架由N—乙酰葡糖胺和N—乙酰塔羅糖胺糖醛酸以"—1，3糖苷鍵交替連接而成，連在后一氨基糖上的肽尾由L—Glu、L—Ala和L—Lys 3個L型氨基酸組成，肽橋則由L—Gin一個氨基酸組成。
10 缺壁細菌(cell wall deficient bacteria) 細胞壁缺乏或缺損的各種細菌的統(tǒng)稱，包括支原體、L型細菌、原生質(zhì)體和球狀體等。
11 L型細菌(L form ofbacteria) 指在實驗室或宿主體內(nèi)通過自發(fā)突變而形成的遺傳性穩(wěn)定的細胞壁缺陷菌株。因最初發(fā)現(xiàn)的念珠狀鏈桿菌(Streptobacillus monil扣rmis)是在英國Lister研究所發(fā)現(xiàn)，故稱L型細菌。
12 原生質(zhì)體(protoplast) 在人為條件下，用溶菌酶除盡細菌等微生物原有細胞壁或用青霉素抑制新生細胞壁合成后，所得到的僅有一層細胞膜包裹著的圓球狀細胞，一般由C’細菌形成。原生質(zhì)體對滲透壓敏感，無繁殖能力，在合適條件下，細胞壁可再生，并恢復(fù)其繁殖能力。
13 球狀體(sphaeroplast) 又稱原生質(zhì)球，指還殘留有部分細胞壁的原生質(zhì)體。G—細菌一般只形成球狀體。
14 細菌細胞質(zhì)膜(cytoplasmic membrane Ofbacteria) 又稱細菌細胞膜。是緊貼在細菌細胞壁內(nèi)側(cè)、包圍著細胞質(zhì)的一層柔軟、脆弱、富有彈性的半透性薄膜，厚約?～8nm，由磷脂(占20％-30％)和蛋白質(zhì)(占50％～70％)組成。細胞質(zhì)膜的主要功能是選擇性的控制細胞內(nèi)外的物質(zhì)交流。
15 間體(mesosome) 細菌細胞中的一種由細胞質(zhì)膜內(nèi)褶而形成的囊狀構(gòu)造，其中充滿著層狀或管狀的泡囊。多見于G’細菌。每個細胞含一至幾個。其功能與DNA的復(fù)制、分配，細胞分裂和酶的分泌有關(guān)。
16 細菌的細胞質(zhì)(cytoplasm ofbacteria) 細菌細胞質(zhì)膜包圍的除核區(qū)以外的一切半透明 膠狀、顆粒狀物質(zhì)的總稱。主要成分為顆粒狀內(nèi)含物，核糖體、酶類、中間代謝物、質(zhì)粒、各種營養(yǎng)牧和大分子的單體等。
17 細菌的內(nèi)含物(inclusionbody ofbacteria) 細胞質(zhì)內(nèi)形狀較大的顆粒和泡囊狀構(gòu)造，包括各種貯藏物、羧酶體、氣泡或磁小體等。
18 聚—β—羥丁酸(poly—β hydroxybutyrate PHB) 存在于某些細菌細胞質(zhì)內(nèi)的顆粒狀內(nèi)含物，由許多羥基丁酸分子聚合而成，具貯藏能量、碳源和降低細胞內(nèi)滲透壓的作用。
19 異染粒(metachromatic granules) 又稱迂回體或捩轉(zhuǎn)菌素，是無機偏磷酸鹽的聚合物，具有貯藏磷元素和能量的功能。在白喉棒桿菌和結(jié)核分枝桿菌中易見到異染粒。
20 羧酶體(carboxysome) 存在于一些自養(yǎng)細菌細胞內(nèi)的多角形或六角形內(nèi)含物，內(nèi)含1，5—二磷酸核酮糖羧化酶，在自養(yǎng)細菌的CO2：固定中起著關(guān)鍵作用。
21 核區(qū)(nuclear region) 又稱核質(zhì)體，指原核生物所特有的無核膜結(jié)構(gòu)、無固定形態(tài)的原始細胞核。其成分是一個大型環(huán)狀雙鏈DNA分子，它是細菌負載遺傳信息的主要物質(zhì)基礎(chǔ)。
22 芽孢(endospore) 某些細菌在其生長發(fā)育后期，在細胞內(nèi)形成的一個圓形或橢圓形、厚壁、含水量極低、抗逆性(抗熱、化學(xué)藥物、輻射等)極強的休眠體。產(chǎn)芽孢的細菌主要有芽孢桿菌屬(Bacillus)和梭菌屬(Clostridium)兩屬。
23 滲透調(diào)節(jié)皮層膨脹學(xué)說(osmoregulatory expanded cortex theory) 解釋芽孢耐熱機制的一個較新的學(xué)說。它認為芽孢的耐熱性在于芽孢衣對多價陽離子和水分的透性很差，以及皮層的離子強度很高，從而使皮層產(chǎn)生極高的滲透壓去奪取芽孢核心中的水分，其結(jié)果導(dǎo)致皮層的充分膨脹，而作為芽孢的生命部分——芽孢核心的細胞質(zhì)卻發(fā)生高度失水，并由此變得高度耐熱了。
24 伴孢晶體(parasporalcrystal) 蘇云金芽孢桿菌等少數(shù)芽孢桿菌在其形成芽孢的同時，會在芽孢旁形成一顆菱形或雙錐形的堿溶性蛋白晶體(6內(nèi)毒素)，稱為伴孢晶體。它對約200種昆蟲尤其是鱗翅目的幼蟲有毒殺作用，故可制成細菌殺蟲劑。
25 糖被(glycocalyx) 指包被于某些細菌細胞壁外的一層厚度不定的膠狀物質(zhì)。糖被有數(shù)種：①形態(tài)固定、層次厚的為莢膜。②形態(tài)固定、層次薄的為微莢膜。③形態(tài)不固定、結(jié)構(gòu)松散的為黏液層。④包裹在細胞群體上有一定形態(tài)的糖被稱菌膠團。糖被的主要功能是保護菌體免受干旱損傷或被宿主免疫活性細胞吞噬。
26 細菌鞭毛(flagella ofbacteria) 生長在某些細菌體表的長絲狀、波曲、可旋轉(zhuǎn)的蛋白質(zhì)附屬物，其數(shù)目一至數(shù)十條，具有運動功能。鞭毛由基體、鉤形鞘和鞭毛絲3部分組成。鞭毛在細菌表面的著生方式有一端生、兩端生、周生和側(cè)生等數(shù)種，它是細菌鑒定中的重要指標。
27 菌毛(fimbriae) 一種長在細菌體表的纖細、中空、短直、數(shù)量較多的蛋白質(zhì)附屬物，具有使菌體附著于物體表面的功能。有菌毛者多屬C—致病細菌。菌毛的功能是使細菌可牢固地黏附于寄主的呼吸道、消化道或泌尿生殖道等的黏膜細胞上，以利定植和致病。
28 性毛(pili，sex pili) 又稱性菌毛。構(gòu)造和成分與菌毛相同，但比菌毛長、粗。每個細菌一般僅著生一至少數(shù)幾條性毛。多見于G—細菌的雄性菌株上，其主要功能是向雌性菌株傳遞遺傳物質(zhì)。
29 真核微生物(eukaryoticmicrooganisms) 凡是細胞核具有核膜、細胞能進行有絲分裂、細胞質(zhì)中存在線粒體或同時存在葉綠體等細胞器的生物，稱真核生物。微生物中的真菌、顯微藻類、原生動物和地衣均屬于真核生物，故可稱為真核微生物。
30 “9+2”型鞭毛(“9+2”typeflagella) 在某些真核細胞表面長有毛發(fā)狀、具有運動功能的細胞器，稱為鞭毛。它由基體、過渡區(qū)和鞭桿3部分組成，因其鞭桿的橫切面的中央可見到兩個中央微管，其周圍則有9個微管二聯(lián)體圍繞一圈，故真核生物的鞭毛又稱“9+2”型鞭毛。
31 細胞核(nucleus) 存在于一切真核細胞中的形態(tài)完整、有核膜包裹的細胞核，它是細胞內(nèi)遺傳信息(：DNA)的儲存、復(fù)制和轉(zhuǎn)錄的主要部位，并對細胞的生長、發(fā)育、繁殖以及遺傳和變異等生命活動起著決定性的作用。細胞核由核被膜、染色質(zhì)、核仁和核基質(zhì)等構(gòu)成。
32 染色質(zhì)(chromatin) 真核細胞處于分裂的間期時，其細胞核內(nèi)的DNA和組蛋白等組成一種線性、可被蘇木精等堿性染料染色的復(fù)合物，稱為染色質(zhì)。染色質(zhì)的基本單位是核小體。
33 染色體(chromasome) 真核細胞進行有絲分裂或減數(shù)分裂時，其染色質(zhì)絲通過盤繞、折疊，由核小體經(jīng)中空螺線管至超螺旋環(huán)，最后濃縮成在光學(xué)顯微鏡下可見的棒狀結(jié)構(gòu)，即稱染色體。
34 核小體(nucleosome) 構(gòu)成真核細胞染色質(zhì)的基本單位。其核心結(jié)構(gòu)為組蛋白八聚體，由H2A、H2B、H3和H4分子各一對組成，在八聚體外有以左手方向盤繞兩周的DNA鏈，另有一個組蛋白分子H1，與連接DNA相結(jié)合，鎖住了核小體的進出口，從而保持其結(jié)構(gòu)穩(wěn)定。
35 核仁(nucleolus) 細胞核中一個沒有膜包裹的圓形或橢圓形小體。每個核中有一至數(shù)，富含蛋白質(zhì)和RNA，是真核細胞中合成rRNA和裝配核糖體的部位。
36 核基質(zhì)(nuclearmatrix) 舊稱核液。一種充滿于細胞核空間由蛋白纖維組成的網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)，具有支撐細胞核和為染色質(zhì)提供附著點的功能。
37 細胞器(organelle) 細胞質(zhì)內(nèi)具有一定形態(tài)、構(gòu)造和功能的微型器，自，一般有膜包裹，如內(nèi)質(zhì)網(wǎng)、高爾基體、溶酶體、線粒體和葉綠體等。
38 細胞骨架(cytoskeleton) 一種由微管、肌動蛋白和中間絲3種蛋白質(zhì)纖維所構(gòu)成的細胞支架，具有支持、運輸和運動功能。
39 內(nèi)質(zhì)網(wǎng)(endoplasmic reticulum) 細胞質(zhì)中一個與細胞基質(zhì)相隔離、但彼此相通的囊腔和細管系統(tǒng)，由脂質(zhì)雙分子層圍成。有兩類，其一因膜上附有核糖體顆粒，稱糙面內(nèi)質(zhì)網(wǎng)，具有合成和運送胞外分泌蛋白至高爾基體中去的功能；其二為膜上無核糖體的光面內(nèi)質(zhì)網(wǎng)，是脂代謝、鈣代謝和合成磷脂的部位。
40 核糖體(ribosome) 是一種無膜包裹的顆粒狀細胞器，具有合成蛋白質(zhì)的功能。外層為蛋白質(zhì)，內(nèi)層為RNA。每個細胞中有大量的核糖體。原核生物具有70 S核糖體，而真核生物則有80S核糖體。
41 高爾基體(Golgi apparatus) 是一種由數(shù)個平行堆疊的扁平膜囊和大小不等的囊泡所組成的膜聚合體，具有合成、分泌糖蛋白和脂蛋白，對某些蛋白質(zhì)原進行酶切加工，以及對新細胞壁和細胞膜提供合成原料等多種功能。
42 溶酶體(lysosome) 一種由單層膜包裹、內(nèi)含多種酸性水解酶的囊泡狀細胞器，具有進行細胞內(nèi)消化的功能。
43 微體(microbody) 一種由單層膜包裹、與溶酶體相似的球狀細胞器。真核微生物的微體主要含一至幾種氧化酶類，這類微體又稱過氧化物酶體。
44 線粒體(mitochondria) 一種由雙層膜包裹的、執(zhí)行氧化磷酸化產(chǎn)能反應(yīng)的重要細胞器，一般呈桿菌狀，數(shù)量很多。由內(nèi)外兩層膜包裹，內(nèi)膜向內(nèi)伸展，形成許多嵴，其上著生許多基粒(即為ATP合成酶復(fù)合體)以及4種脂蛋白復(fù)合物(呼吸鏈成分)。在線粒體的基質(zhì)內(nèi)含有TCA酶系、一套半自主復(fù)制的雙鏈環(huán)狀DNA以及70S核糖體。
45 葉綠體(chloroplast) 一種由雙層膜包裹的、能捕獲光能并把它轉(zhuǎn)化為化學(xué)能的綠色顆粒狀細胞器，只存在于藻類和綠色植物中。一般由葉綠體膜、類囊體和基質(zhì)3部分構(gòu)成�；|(zhì)內(nèi)含 有能進行半自主復(fù)制的雙鏈環(huán)狀DNA 1)~及70S核糖體。
第四章 微生物的營養(yǎng)
一、術(shù)語和名詞
1 營養(yǎng)物質(zhì)(nutrient)微生物從外界攝取的用于生物合成和產(chǎn)生能量的物質(zhì)，以滿足微生物生長、繁殖和完成各種生理代謝活動。
2 主要元素或大量元素(macroelement) 微生物細胞干重的95％以上由碳、氫、氧、氮、磷、硫、鉀、鈣、鎂、鐵等少數(shù)幾種元素組成，將這些微生物生長需要量相對較大的元素稱為主要元素。
3 微量元素(trace element或microelement) 微生物細胞需要量很小的元素，包括錳、鋅、銅、鈷、鎳、硒等。
4 碳源(source ofcarbon) 為微生物生長提供碳素來源的物質(zhì)。
5 氮源(source ofnitrogen) 為微生物生長提供氮素來源的物質(zhì)
6 蛋白胨(peptone) 將肉、酪素或明膠用酸或蛋白酶水解后干燥而成的，富含有機氮化合物及一些維生素和糖類的粉末狀物質(zhì)，用于配制培養(yǎng)基。
7 牛肉浸膏(beef extract) 瘦牛肉組織浸出汁濃縮而成的，富含水溶性糖類、有機氮化合物、維生素、鹽等的膏狀物質(zhì)，用于配制培養(yǎng)基。
8 酵母浸膏(yeast extract) 酵母細胞水溶性提取物濃縮而成的，富含B類維生素及一些有機氮化合物和糖類的膏狀物質(zhì)，用于配制培養(yǎng)基。
9 生長因子(growth factor)微生物生長所必需且需要量很小，而微生物自身不能合成或合成量不足以滿足機體生長需要的有機化合物。
10 水活度值(water。activity，aw ) 一定溫度和壓力條件下，溶液的蒸汽壓力與同樣條件下純水蒸氣壓力之比值。大多數(shù)微生物只能在水活度值接近0.98或更高的環(huán)境中生長。
11 自養(yǎng)型生物(autotroph) 以CO2為惟一或主要碳源的生物。
12 異養(yǎng)型生物(1leterotroph) 以還原性有機物為主要碳源的生物。
13 光能營養(yǎng)型生物(phototroph) 以光能為能源的生物。
14 化能營養(yǎng)型生物(chemotroph) 以有機物或無機物氧化釋放的化學(xué)能為能源的生物。
15 無機營養(yǎng)型生物(1ithotroph) 以還原性無機物為電子供體的生物。
16 有機營養(yǎng)型生物(organotroph) 以有機物為電子供體的生物。
17 光能無機自養(yǎng)型(photolithoautotrophy) 利用光能、無機電子供體(H2、H20、H2S、S等)并以C02為碳源的生物。
18 光能有機自養(yǎng)型(hotoorganoheterotroph) 利用光能并以有機物作為電子供體及碳源的生物。
19 化能無機自養(yǎng)型(chemolithoautotrophy) 氧化還原性無機物獲得能量和電子，以CO2為碳源的生物。
20 化能有機異養(yǎng)型(chemoorganoheterotrophy) 氧化有機物獲得能源、電子及碳源的生物。
21 腐生型(metatrophy) 利用無生命的有機物(如動植物尸體和殘體)的化能有機異養(yǎng)型生物。
22 寄生型(paratrophy) 寄生在活的寄主機體中的化能有機異養(yǎng)型生物，離開寄主不能生存。
23 兼養(yǎng)型生物(mixotroph) 兼有自養(yǎng)和異養(yǎng)代謝過程的微生物，利用無機電子供體和有機碳源。
24 原養(yǎng)型(prototroph) 與自然發(fā)生的同種其他個體一樣，具有相同營養(yǎng)需求的微生物。
25 培養(yǎng)基(culture medium) 由人工配制的、適合微生物生長、繁殖或產(chǎn)生代謝產(chǎn)物的營養(yǎng)基質(zhì)。
26 復(fù)合(天然)培養(yǎng)基(complex medium) 含有化學(xué)成分尚不完全清楚或化學(xué)成分不恒定的天然有機物的培養(yǎng)基，也稱非化學(xué)限定培養(yǎng)基(chemically undefined medium)。
27 合成培養(yǎng)基(synthetic medium) 由化學(xué)成分完全了解的物質(zhì)配制而成的培養(yǎng)基，也稱化學(xué)限定培養(yǎng)基(chemically defined medium)。
28 固體培養(yǎng)基(solid medium) 在液態(tài)培養(yǎng)基中加入一定量凝固劑而制成的固體狀態(tài)的培養(yǎng)基。
29 半固體培養(yǎng)基(semisolid medium)在液態(tài)培養(yǎng)基中加入凝固劑的量比固體培養(yǎng)基中的少而制成的半固體狀態(tài)的培養(yǎng)基。
30 液體培養(yǎng)基(1iquid medium) 不含凝固劑的液態(tài)培養(yǎng)基。
31 基礎(chǔ)培養(yǎng)基(minimum medium) 含有一般微生物生長所需基本營養(yǎng)物質(zhì)的培養(yǎng)基。
32 加富培養(yǎng)基(enrichment medium) 在基礎(chǔ)培養(yǎng)基中加入某些特殊營養(yǎng)物質(zhì)，用于培養(yǎng)營養(yǎng)要求比較苛刻的異養(yǎng)型微生物的培養(yǎng)基。
33 鑒別培養(yǎng)基(differential medium) 在培養(yǎng)基中加入能與特定微生物的代謝產(chǎn)物發(fā)生特征性化學(xué)反應(yīng)的化學(xué)物質(zhì)，用于鑒別不同類型微生物。
34 選擇培養(yǎng)基(selective medium) 根據(jù)不同微生物的營養(yǎng)需求或?qū)δ撤N化學(xué)物質(zhì)敏感性不同，在培養(yǎng)基中加入相應(yīng)營養(yǎng)物質(zhì)或化學(xué)物質(zhì)，抑制不需要微生物的生長，將所需微生物從復(fù)雜的微生物群體中選擇分離出來。
35 瓊脂(agar) 由藻類(石花菜)中提取的一種高度分支的復(fù)雜多糖，用作凝固劑配制固體、半固體培養(yǎng)基。
36 明膠(gelatin) 由膠原蛋白制備的培養(yǎng)基凝固劑。
37 透過屏障(permeability barrier) 微生物細胞表面由原生質(zhì)膜、細胞壁、莢膜及黏液層組
成的限制物質(zhì)進出細胞的屏障。
38 擴散(diffusion) 營養(yǎng)物質(zhì)通過原生質(zhì)膜上的含水小孔，由高濃度胞外(內(nèi))環(huán)境向低濃度胞內(nèi)(外)進行運輸?shù)倪^程。
39 促進擴散(facilitated diffusion) 營養(yǎng)物質(zhì)由載體(透過酶)輔助的跨質(zhì)膜擴散過程。
40 透過酶(permease) 一種由膜結(jié)合載體蛋白質(zhì)或由兩種以上蛋白質(zhì)組成的系統(tǒng)，能幫助營養(yǎng)物質(zhì)跨膜運輸。
41 被動運輸(passive transport) 包括擴散和促進擴散在內(nèi)的依靠膜內(nèi)外被運輸物質(zhì)濃度差而進行的物質(zhì)運輸方式。
42 主動運輸(active transport) 在載體的幫助下，依靠細胞提供的能量進行的物質(zhì)跨膜運輸，可以進行逆濃度運輸。
43 初級主動運輸(primary active transport) 由電子傳遞系統(tǒng)、ATP酶及細菌視紫紅質(zhì)引起的質(zhì)子跨膜運輸，在原生質(zhì)膜內(nèi)外建立質(zhì)子濃度差。
44 能化膜(energized membrane) 細胞通過消耗呼吸能、化學(xué)能及光能，引起胞內(nèi)質(zhì)子(或其他離子)外排，在原生質(zhì)膜內(nèi)外建立質(zhì)子濃度差(或電勢差)，使膜處于充能狀態(tài)。
45 次級主動運輸(secondary active transport) 能化膜質(zhì)子濃度差(或電勢差)消失過程中偶聯(lián)的其他物質(zhì)的運輸。
46 同向運輸(symport) 某種物質(zhì)與質(zhì)子通過同一載體以相同方向進行的次級主動運輸。
47 逆向運輸(antiport) 某種物質(zhì)與質(zhì)子通過同一載體以相反方向進行的次級主動運輸。
48 單向運輸(uniport) 在能化膜質(zhì)子濃度差(或電勢差)消失過程中，某種物質(zhì)單獨通過某一載體進行的次級主動運輸。
49 基團轉(zhuǎn)位(group translocation) 物質(zhì)通過載體幫助，在一個較復(fù)雜的運輸系統(tǒng)的作用下進行的跨膜主動運輸，被運輸物質(zhì)在該過程中化學(xué)性質(zhì)發(fā)生改變。
50 Na+，K+一ATP酶(Na+，K+一ATPase) 存在于原生質(zhì)膜上的一種離子通道蛋白，利用ATP的能量將胞內(nèi)Na+‘泵”出胞外，而將胞外K+‘泵”入胞內(nèi)，也稱Na+，K+一泵。
51 ATP結(jié)合盒式轉(zhuǎn)運蛋白(ATP—binding cassette transporters，ABC transporters) 利用ATP的能量跨膜轉(zhuǎn)運物質(zhì)而不改變其化學(xué)性質(zhì)的膜蛋白復(fù)合體，需要一種質(zhì)膜外底物結(jié)合蛋白來行使功能，簡稱ABC轉(zhuǎn)運蛋白。
52 膜泡運輸(membrane vesicle transport) 存在于真核微生物(如變形蟲)中的一種通過胞吞作用運輸營養(yǎng)物質(zhì)的方式。
53 胞吞作用(endocytosis) 細胞通過原生質(zhì)膜吸附、包裹并吸收溶質(zhì)或顆粒物質(zhì)的過程。
54 胞飲作用(pinocytosis) 通過原生質(zhì)膜包裹液態(tài)物質(zhì)的胞吞作用。
55 吞噬作用(phagocytosis) 通過原生質(zhì)膜包裹顆粒狀物質(zhì)的胞吞作用。
56 鐵載體(siderophore) 微生物細胞向胞外分泌的一種能絡(luò)合Fe3+的小分子化合物，鐵一鐵載體復(fù)合物通過ABc轉(zhuǎn)運蛋白進入細胞。
第五章 微生物代謝
一、術(shù)語或名詞
1 分解代謝(catabolism) 也稱產(chǎn)能代謝，生物氧化，是指大分子物質(zhì)在細胞內(nèi)降解成小分子物質(zhì)，并產(chǎn)生能量的過程。
2 合成代謝(anabolism) 是指利用小分子物質(zhì)在細胞內(nèi)合成復(fù)雜大分子物質(zhì)，并消耗能量的過程。
3 糖酵解(glycolysis) 無氧條件下，異養(yǎng)生物降解葡萄糖生成兩個丙酮酸并產(chǎn)生能量的過程。是葡萄糖分解代謝的共同途徑。
4 發(fā)酵(fermentation) 廣義的發(fā)酵，泛指一切利用微生物進行生產(chǎn)的過程，多指傳統(tǒng)的與實際生產(chǎn)有關(guān)的工業(yè)化生產(chǎn)，多是好氧過程，如氨基酸發(fā)酵、抗生素發(fā)酵、單細胞蛋白生產(chǎn)等。微生物生理學(xué)上的發(fā)酵又稱狹義的發(fā)酵，是指微生物細胞將有機物氧化釋放的電子直接交給底物本身未完全氧化的某種中間產(chǎn)物，同時釋放能量并產(chǎn)生各種不同的代謝產(chǎn)物的過程。
5 底物水平磷酸化(substrate—level phosphorylation) 發(fā)酵過程中往往伴隨著一些高能化合物的生成，如EMP途徑中的甘油酸一1，3一二磷酸和磷酸烯醇式丙酮酸。這些高能化合物可以直接偶聯(lián)ATP或GTP的生成。底物水平磷酸化可以存在于發(fā)酵過程中，也可以存在于呼吸過程中，但產(chǎn)生能量相對較少。
6 乙醇發(fā)酵(alcoholic fermentation) 有兩種方式，葡萄糖在酵母和某些細菌(如Sarcina、：Enterobacteriaceae)中經(jīng)EMP途徑，或者某些細菌(如運動發(fā)酵假單胞菌)中經(jīng)ED途徑降解成丙酮酸，進一步生成乙醛，乙醛還原生成乙醇。
7 乳酸發(fā)酵(1actic acid fermentation) 有兩種方式，葡萄糖經(jīng)EMP途徑降解為丙酮酸，丙酮酸在乳酸脫氫酶的作用下被NADH還原為乳酸，終產(chǎn)物只有一種乳酸，稱為同型乳酸發(fā)酵(1lomolactic fermentation)；葡萄糖經(jīng)PK、HK或HMP途徑降解為丙酮酸，代謝終產(chǎn)物除乳酸外，還有乙醇或乙酸，故稱異型乳酸發(fā)酵（heterolactic fermentation）。
8 呼吸(respiration) 微生物在降解底物的過程中，將釋放出的電子交給NAD(P)’、FAD或FMN等電子載體，再經(jīng)電子傳遞系統(tǒng)傳給外源電子受體，從而生成水或其他還原型產(chǎn)物并釋放出能量的過程。以分子氧作為最終電子受體的稱為有氧呼吸(aerobic respiration)，以氧化型化合物作為最終電子受體的稱為無氧呼吸(anaerobic respiration)。
9 電子傳遞系統(tǒng)(electron transport system) 一系列膜相關(guān)電子載體，把電子傳遞給最終的電子受體，除了泛醌之外，電子載體在膜上的排列順序為還原電位最負到最正。一般電子傳遞系統(tǒng)的組成及電子傳遞方向為：NAD(P)一FP(黃素蛋白)一Fes(鐵硫蛋白)一CoQ(輔酶Q)一cyt b_Cyt c_Cyt aCyta3。
10 氧化磷酸化(oxidative phosphorylation) 在糖酵解和三羧酸循環(huán)過程中，形成的NAD(P)H和FADH：，通過電子傳遞系統(tǒng)將電子傳遞給電子受體(氧或其他氧化性化合物)，同時偶聯(lián)ATP合成的生物過程。
11 巴斯德效應(yīng)(Pasteur effect) 當微生物從厭氧條件轉(zhuǎn)換到有氧條件時，微生物轉(zhuǎn)向有氧呼吸，糖分解代謝速率降低。
12 反硝化作用(denitrification) 又稱硝酸鹽呼吸(nitrate respiration)，以硝酸或亞硝酸鹽為電子受體進行的無氧呼吸，此過程中硝酸鹽還原形成氣態(tài)產(chǎn)物NO、N2。
13 同化型硝酸還原(assimilative nitrate reduction) 在厭氧或好氧條件下，某些兼性厭氧細菌還原硝酸為亞硝酸，進一步轉(zhuǎn)變成銨，作為氮源被細胞利用。
14 異化型硝酸還原(dissimilartive nitrate reduction) 硝酸作為最終電子受體被還原成亞硝酸，分泌到細胞外或形成N：被釋放。在這個過程中，硝酸只作為電子受體，用于生物氧化產(chǎn)能，而不作為細胞氮源。
15 Stickland反應(yīng)(Stickland reaction) 某些微生物利用氨基酸作為碳源、能源和氮源。以一種氨基酸作為供氫體而氧化，另一種氨基酸作為電子受體被還原的生物氧化產(chǎn)能方式，產(chǎn)能效率低，每分子氨基酸產(chǎn)生1個ATP。
16 化能自養(yǎng)菌(chemoautotrophs) 還原CO2的ATP和還原力[H]是通過還原性無機化合物(NH4+、NO2＿、H2S、S0、H2和Fe2+)的氧化而獲得的，產(chǎn)能途徑是氧化磷酸化，一般為好氧菌。
17 不產(chǎn)氧光合作用(anoxygenic photosynthesis) 又稱環(huán)式光合磷酸化，光合細菌所特有。光能驅(qū)動下，電子從菌綠素分子出發(fā)，通過電子傳遞鏈的循環(huán)，又回到菌綠素，期間產(chǎn)生ATP，還原力來自環(huán)境中的無機化合物供氫，不產(chǎn)生氧氣。
18 產(chǎn)氧光合作用(oxygenic photosynthesis) 又稱非環(huán)式光合磷酸化，綠色植物、藻類和藍細菌所共有。光能驅(qū)動下，電子從光反應(yīng)中心I(Ps I)的葉綠素a出發(fā)，通過電子傳遞鏈，連同光反應(yīng)中心Ⅱ(PsⅡ)水的光解生成的H’，生成還原力；光反應(yīng)中心Ⅱ(PsⅡ)由水的光解產(chǎn)生氧氣和電子，電子通過電子傳遞鏈，傳給光反應(yīng)中心Ps I，期間生成ATP。
19 紫膜光合磷酸化(photophosphorylation by purple membrane) 紫膜由細菌視紫紅質(zhì)蛋白和類脂組成，細菌視紫紅質(zhì)蛋白功能與葉綠素相似，能吸收光能，并在光量子驅(qū)動下起著質(zhì)子泵的作用，將質(zhì)子泵出紫膜外，從而形成紫膜內(nèi)外的質(zhì)子梯度差(質(zhì)子動勢)，驅(qū)使ATP的形成。
20 代謝補償途徑(replenishment pathway) 或代謝物回補順序(anaplerotic sequence)，是指能補充兩用代謝途徑中因合成代謝而消耗的中間代謝產(chǎn)物的那些反應(yīng)。如微生物特有的乙醛酸循環(huán)。
21 初級代謝(primary metabolism) 微生物細胞從外界吸收營養(yǎng)物質(zhì)，通過分解和合成代謝，生成維持生命活動所必需的物質(zhì)和能量的過程。
22 次級代謝(secondary metabolism) 微生物在一定的生長時期，以初級代謝產(chǎn)物為前體，合成一些對微生物自身生命活動無明確生理功能的物質(zhì)的過程。
23 變構(gòu)效應(yīng)(allosterism) 別構(gòu)酶的活性可以被小分子激活劑或者抑制劑改變，激活劑或者抑制劑借助于非共價鍵，可逆地同酶蛋白分子上的調(diào)控部位相結(jié)合，引起酶的三維結(jié)構(gòu)的改變，導(dǎo)致酶的催化部位的活性發(fā)生變化。
24 反饋抑制(feedback inhibition) 每個代謝途徑都至少有一個限速酶 (pacemaker enzyme)，催化代謝途徑中的限速反應(yīng)，一般是代謝途徑中第一步反應(yīng)的催化酶。代謝途徑的終端產(chǎn)物常常抑制第一步反應(yīng)的可調(diào)控酶的活性，此調(diào)控作用稱為反饋抑制。
25 酶合成阻遏(repression of enzyme synthesis) DNA分子上每一個操縱元都產(chǎn)生一個阻遏蛋白，在合成過程中，阻遏蛋白不能結(jié)合在操縱子部位上。然而，輔阻遏物可以與阻遏蛋白結(jié)合，改變阻遏蛋白的構(gòu)象，因此可以與操縱子部位結(jié)合。這樣mRNA的合成終止，蛋白質(zhì)合成不能發(fā)生。
26 酶合成誘導(dǎo)(induction of enzyme synthesis) 調(diào)節(jié)基因產(chǎn)生的阻遏蛋白可以與操縱元上的操縱子部位結(jié)合，因此關(guān)閉了mRNA的轉(zhuǎn)錄，阻止了蛋白質(zhì)的合成。當培養(yǎng)基中加入誘導(dǎo)物時，誘導(dǎo)物與阻遏蛋白結(jié)合，阻止了阻遏蛋白與操縱子部位的結(jié)合，操縱子開放，基因轉(zhuǎn)錄發(fā)生。
第六章 微生物的生長繁殖及其控制
一、術(shù)語或名詞
1 二分裂(binary fission) 細胞核首先進行有絲分裂，然后細胞質(zhì)通過胞質(zhì)分裂而分開，從而形成兩個相同的個體的分裂方式。
2 分批培養(yǎng)(batch culture) 是指微生物在封閉系統(tǒng)中進行的培養(yǎng)，培養(yǎng)過程中不對培養(yǎng)基進行更換。
3 遲緩期(1agphase) 微生物接種到新鮮培養(yǎng)基時，其數(shù)量并不立即增加，這個階段被稱為遲緩期或延滯期。
4 對數(shù)生長期(exponentialphase) 微生物經(jīng)過延滯期后，以最大的速度進行生長和分裂，導(dǎo)致微生物數(shù)量呈對數(shù)增加的時期。在對數(shù)生長期微生物各成分按比例有規(guī)律地增加，微生物呈平衡生長。
5 穩(wěn)定生長期(stationaryphase) 微生物經(jīng)過對數(shù)生長期后，生長速度降低至零(細菌分裂增加的數(shù)量等于細菌死亡數(shù)量)的時期。穩(wěn)定期的微生物數(shù)量最大并維持穩(wěn)定。
6 衰亡期(deathphase) 穩(wěn)定期后，由于營養(yǎng)物質(zhì)的耗盡和有毒代謝產(chǎn)物的大量積累，使微生物死亡速度逐步增加，活菌減少的時期。
7 二次生長(diauxic growth) 微生物在同時含有速效碳源(或氮源)和遲效碳源(或氮源)的培養(yǎng)基中生長時，微生物會首先利用速效碳源(或氮源)生長直到該速效碳源(或氮源)耗盡，然后經(jīng)過短暫的停滯后，再利用遲效碳源(或氮源)重新開始生長。這種兩相生長或應(yīng)答稱為二次生長。
8 倍增時間(doublingtime) 群體生長中微生物數(shù)量增加一倍所需要的時間稱為倍增時間。
9 代時(generationtime) 個體生長中，每個微生物分裂繁殖一代所需的時間稱為代時。
10 比生長速率(specificgrowth rate) 每單位數(shù)量的微生物在單位時間內(nèi)增加的量。
11 同步培養(yǎng)(synchronousculture) 使群體中不同步的細胞轉(zhuǎn)變成能同時進行生長或分裂的群體細胞的培養(yǎng)方法稱為同步培養(yǎng)。
12 同步生長(synchronousgrowth) 以同步培養(yǎng)方法使群體細胞處于同一生長階段，并同時進行分裂的生長方式。
13 連續(xù)培養(yǎng)(continuousculture) 連續(xù)培養(yǎng)是指通過一定的方式使微生物能以恒定的比生長速率生長并能持續(xù)生長下去的培養(yǎng)方法。一般是通過在微生物培養(yǎng)過程中不斷地補充營養(yǎng)和以同樣的速率移出培養(yǎng)物來實現(xiàn)微生物的連續(xù)培養(yǎng)。
14 恒化器(chemostat) 通過保持培養(yǎng)基中某種必需營養(yǎng)物質(zhì)的濃度基本恒定的方式，使微生物的生長速度恒定的培養(yǎng)系統(tǒng)。
15 平板計數(shù)或菌落計數(shù)(plate countor colonycount) 將適當稀釋的樣品涂布到瓊脂培養(yǎng)基表面，培養(yǎng)后活細胞能形成菌落，通過計算菌落數(shù)能知道樣品中的活菌數(shù)，該方法稱為平板計數(shù)或菌落計數(shù)。
16 菌落形成單位(colonyforming unit) 采用平板計數(shù)或菌落計數(shù)法時，由于不能絕對保證一個菌落只是由一個活細胞形成，計算出的活細胞數(shù)稱為菌落形成單位。
17 顯微鏡直接計數(shù)(directmicroscopic count) 利用微生物計數(shù)板或血細胞計數(shù)板，在顯微鏡對樣品中的微生物進行計數(shù)的方法稱為顯微鏡直接計數(shù)法。該方法雖然簡便直觀，但若無特別技術(shù)不能區(qū)分死活細胞的數(shù)目。
18 最適生長溫度(optimum growth temperature) 微生物生長速度最快的溫度。
19 超氧化物歧化酶(superoxidedismutase) 催化超氧化物自由基形成氧和過氧化氫的酶。
20 過氧化氫酶(catalase) 分解過氧化氫形成水和氧氣的酶。
21 滅菌(sterilization) 滅菌是指物體中包括芽孢在內(nèi)的所有微生物都被殺死或消除。
22 抑制(inhibition) 抑制是采用某種因子使微生物的生長停止，但移去該因子后微生物的生長仍然可以恢復(fù)。
23 消毒(disinfection) 殺死或滅活物質(zhì)或物體中所有病原微生物的措施。消毒可起到防止感染或傳播的作用。
24 消毒劑(disinfectant) 用于消毒的化學(xué)制劑。一般用于對非生物材料的消毒。
25 石炭酸系數(shù)或酚系數(shù)(phenol coefficient) 在一定溫度下將某種消毒劑與試驗細菌10rain保溫處理后，能殺死試驗細菌的消毒劑的最高稀釋倍數(shù)與能殺死試驗細菌的石炭酸(酚)的最高稀釋倍數(shù)的比值。酚系數(shù)可用于判斷消毒劑對試驗細菌的殺滅效力。酚系數(shù)越高，表明消毒劑在該測試條件下的消毒能力越強。
26 防腐(antisepsis) 采用某些化學(xué)或物理方法防止和抑制微生物生長的措施。防腐能防止食物腐敗或防止其他物質(zhì)霉變。
27 防腐劑(antiseptic) 用于防腐的化學(xué)制劑。防腐劑的毒性一般小于消毒劑，以避免對動物或人體組織產(chǎn)生毒害作用。
28 熱致死時間(thermaldeathtime) 在一定溫度一定條件下殺死液體中所有微生物的最短時間。
29 十倍減少時間(decimal reduction time，D) 特定溫度下殺死某一樣品中90％微生物或孢子及芽孢所需的時間。30 高壓滅菌(autoclave) 在高壓蒸汽的處理下(通常121℃，15rain)殺死包括芽孢在內(nèi)的所有微生物的滅菌方法。
31 巴斯德消毒法(pasteurization) 在低于沸點的溫度下短時間加熱處理以殺死牛奶或飲料中的病原微生物的方法稱為巴斯德消毒法。較老的做法是63℃處理30rain；現(xiàn)在使用巴氏瞬間消毒法(nashpasteurization)即72℃處理15s，然后迅速冷卻的方法。
32 紫外輻射(UVradiation) 波長為10—400 nm(通常采用260nm)的高能輻射。紫外輻射有較強的致死效應(yīng)，通常用于對物體表面和空氣的滅菌。 [
33 選擇毒性(selectivetoxicity) 化療試劑殺死或抑制病原微生物而對宿主盡可能不產(chǎn)生傷害的性質(zhì)。
34 化療(chemotherapy) 利用具有選擇毒性的化學(xué)物質(zhì)殺死生物體內(nèi)的病原微生物或病變細胞，治療被微生物感染的病變細胞或組織，但對機體本身無毒害作用的治療措施。
35 抗生素(antibiotic) 抗生素是由某些生物合成或半合成的次級代謝產(chǎn)物或衍生物，能抑制其他微生物生長或殺死其他微生物。
36 抗代謝物(antimetabolite) 能對代謝的某個關(guān)鍵酶產(chǎn)生競爭抑制而阻斷代謝途徑的化合物�？勾x物通常與酶的正常底物或中間產(chǎn)物很類似，它與酶的正常底物或中間產(chǎn)物競爭酶的活性部位使反應(yīng)停止，從而阻斷代謝途徑。
37 抗藥性(drug resistance) 微生物通過改變本身生理生化特性而變得對化學(xué)藥物不敏感，即微生物的抗藥性。
38 相容溶質(zhì)(compatiblesolute) 適合細胞進行新陳代謝和生長的細胞內(nèi)高濃度物質(zhì)，它可使細胞原生質(zhì)滲透濃度高于周圍環(huán)
第七章 病毒
一、術(shù)語或名詞
1 致細胞病變效應(yīng)(cytopathic effect，CPE) 動物病毒感染敏感細胞培養(yǎng)引起的其顯微表現(xiàn)的改變，如細胞聚集成團、腫大、圓縮、脫落、細胞融合成多核細胞及細胞內(nèi)出現(xiàn)包涵體，乃至細胞裂解等。
2 盲傳(blindpassage) 將取自經(jīng)接種而未出現(xiàn)感染癥狀的宿主或細胞培養(yǎng)的材料，再接種傳遞給新的宿主或細胞培養(yǎng)，即重復(fù)接種，以提高病毒的毒力或效價。
3 感染性測定(assayofinfectivity) 因感染引起宿主或細胞培養(yǎng)某種特異性病理反應(yīng)的感染性病毒顆粒數(shù)量的測定。
4 感染單位(infectionsunit，IU) 能夠引起宿主細胞培養(yǎng)一定特異性病理反應(yīng)的病毒最小劑量。
5 效價(title) 又稱滴度，以單位體積(mL)待測病毒樣品液中所含的病毒感染性單位的數(shù)目(1U／mL)。
6 噬菌斑(plague) 經(jīng)適當稀釋的噬菌體標本接種于細菌平板，經(jīng)過一定時間培養(yǎng)后，在細菌菌苔上形成的圓形局部透明溶菌區(qū)域。
7 蝕斑(plague) 又稱空斑，經(jīng)適當稀釋動物病毒標本接種于動物單層細胞培養(yǎng)，并輔以染色，在細胞單層上形成的可識別的局部病變區(qū)域。
8 半數(shù)效應(yīng)劑量(50％effectdose) 使試驗單元群體中的半數(shù)(50％)個體出現(xiàn)某一感染反應(yīng)所需的病毒劑量，其值以50％試驗單元出現(xiàn)感染反應(yīng)的病毒稀釋液的稀釋度的倒數(shù)的對數(shù)值表。
9 中和作用(neutralization) 特異性的病毒抗體與病毒毒粒作用，使其失去感染性、抑制病毒的繁殖。
10 中和抗體(neutralizingAbs) 能夠中和病毒感染性的病毒抗體。
11 毒粒(virion) 病毒的細胞外顆粒形式，亦是病毒的感染性形式。Dulbacco等(1985)指出，毒粒是一團能夠自主復(fù)制的遺傳物質(zhì)(DNA或RNA)，它們被蛋白質(zhì)外殼包圍，有的還有一附加膜(包膜)以保護其遺傳物質(zhì)免遭環(huán)境破壞，并作為將遺傳物質(zhì)從一個宿主細胞傳遞給另一宿主細胞的載體。
12 殼體(capsid) 又稱衣殼，包圍著病毒核酸的蛋白質(zhì)外殼。
13 蛋白質(zhì)亞基(proteinsubunit) 以次級鍵結(jié)合，構(gòu)成病毒殼體的蛋白質(zhì)單體，其同義語為原體(protomer)
14 殼粒(capsomer) 在病毒的二十面體殼體構(gòu)成中，一定數(shù)目的蛋白質(zhì)亞基，以特殊方式聚集所形成的在電鏡下可見的結(jié)構(gòu)，其同義語為形態(tài)學(xué)單位(morphologicalunit)
15 五聚體(pentamers) 由5個蛋白質(zhì)亞基聚集形成的殼粒，因其在殼體結(jié)構(gòu)中與5個其他的殼粒相鄰，所以又稱五鄰體(penton)。
16 六聚體(hexmers) 由6個蛋白質(zhì)亞基聚集形成的殼粒，因其在殼體結(jié)構(gòu)中與6個其他的殼粒相鄰，所以又稱六鄰體(hexoH)。
17 核殼(nucleocapsid) 又稱核衣殼，病毒的殼體與其包閉著的核酸和內(nèi)部蛋白一起所構(gòu)成的復(fù)合結(jié)構(gòu)，一些簡單的病毒的毒粒就是一個核殼結(jié)構(gòu)。
18 包膜(envelope) 又稱囊膜，一些病毒核殼外所覆蓋著的脂蛋白膜，系病毒成熟時，自細胞質(zhì)膜、核膜或高爾基體膜等以芽出的方式成熟時，由細胞膜衍生而來。病毒包膜的結(jié)構(gòu)與生物膜相似，是脂雙層膜，在包膜形成時，細胞膜蛋白被病毒編碼的包膜糖蛋白取代。
19 刺突(spike) 又稱釘狀物，病毒表面的向外凸出的突起，包膜表面的糖蛋白突起稱包膜突起(peplomer)，或稱膜粒。
20 正鏈RNA(plusstrand RNA) 若病毒的ssRNA可以作為mRNA直接進行翻譯，則規(guī)定它為正極性(+意義)，即為正鏈RNA(+RNA)。
21 負鏈RNA(minusstrand RNA) 若病毒的ssRNA序列與其mRNA互補，則規(guī)定它為負極性(—意義)，即為負鏈(—RNA)。 ·
22 雙意RNA(ambisense RNA) 病毒的ssRNA部分為正極性，部分為負極性。
23 轉(zhuǎn)染(transfection) 將從病毒毒粒或病毒感染的細胞中分離純化的病毒核酸實驗性地導(dǎo)入細胞，現(xiàn)在已用來泛指將外源核酸導(dǎo)人細胞。
24 感染性核酸(infectious nucleic acid) 以轉(zhuǎn)染方式導(dǎo)入細胞后能夠完成復(fù)制循環(huán)，產(chǎn)生病毒子代的病毒核酸，否則為非感染性核酸。
25 分段基因組(segmented genome) 由數(shù)個不同的核酸分子構(gòu)成的病毒基因組。
26 結(jié)構(gòu)蛋白(structure protein) 構(gòu)成一個形態(tài)成熟的感染性病毒顆粒所必需的蛋白質(zhì)，包括殼體蛋白，包膜蛋白和毒粒酶。
27 非結(jié)構(gòu)蛋白(non-structure protein) 由病毒基因組編碼、在病毒復(fù)制時產(chǎn)生并在其中具有一定功能，但不結(jié)合于毒粒之中的蛋白質(zhì)。
28 吸附(attachment) 病毒通過其表面蛋白與敏感宿主細胞的受體特異性結(jié)合，導(dǎo)致病毒顆粒固著于細胞表面的過程，吸附是病毒復(fù)制的第一階段。
29 一步生長試驗(one-step growth experiment) 以適量的病毒同步感染處于標準培養(yǎng)的高濃度敏感細胞，以致可由細胞群體發(fā)生的病毒復(fù)制事件推知單個細胞發(fā)生的病毒復(fù)制的試驗。
30 潛伏期(latent period) 從病毒吸附于細胞到受染細胞釋放出子代病毒所需的最短時間。
3重 裂解量(burstsize) 每個受染細胞所產(chǎn)生的子代病毒顆粒的平均數(shù)目，其值等于穩(wěn)定期病毒效價與潛伏期病毒效價之比。
32 隱蔽期(eclipse period) 自病毒顆粒形式在受染細胞內(nèi)消失到新的感染性病毒子代顆粒出現(xiàn)的時間。
33 病毒入胞(viropexis) 病毒利用細胞的內(nèi)吞功能進入細胞。
34 前基因組(progenome) 乙型肝炎病毒在受染細胞核內(nèi)利用宿主RNA聚合酶轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生的3 4kb mRNA，為病毒利用逆轉(zhuǎn)錄酶進行DNA合成的模板。
35 裝配(assembly) 在病毒感染的細胞內(nèi)，新合成的病毒結(jié)構(gòu)組分以一定方式結(jié)合，裝配成完整的病毒顆粒的過程，亦稱成熟(maturation)或形態(tài)發(fā)生(morphogenesis)
36 允許細胞(permissive cell) 病毒能在其內(nèi)完成復(fù)制循環(huán)，產(chǎn)生子代病毒的細胞，反之病毒不能在其內(nèi)復(fù)制的細胞為非允許細胞。
37 非增殖性感染(uon-productive infection) 由于病毒或是細胞的原因，致使病毒的復(fù)制在病毒進入細胞后的某一階段受阻，結(jié)果沒有子代病毒產(chǎn)生的感染。
38 限制性感染(restrivtive infection) 因細胞的瞬時允許性產(chǎn)生，其結(jié)果或是病毒持續(xù)存在于受染細胞內(nèi)不能復(fù)制，直到細胞成為允許細胞，病毒能繁殖，或是一個細胞群體僅有少數(shù)細胞產(chǎn)生病毒子代。
39 缺損病毒(defective viruses) 基因組有缺損，必須依賴于其他病毒基因或病毒基因組才能復(fù)制的病毒。有生物活性的缺損病毒包括干擾缺損病毒、衛(wèi)星病毒、條件缺損病毒和整合的病毒基因組。
40 干擾缺損病毒(defective interfering viruses) 完全病毒復(fù)制時產(chǎn)生的一類亞基因組的缺失突變體。在病毒以高感染復(fù)數(shù)感染時能以較高頻率產(chǎn)生。由于其基因組有缺損，所以必須依賴于同源的完全病毒才能復(fù)制，同時亦能干擾其完全病毒的復(fù)制。
41 衛(wèi)星病毒(Satillite viruses) 存在于自然界中的一種絕對缺損病毒，其必須依賴于與之無關(guān)的輔助病毒的基因產(chǎn)物才能復(fù)制，同時亦可干擾其輔助病毒的復(fù)制。
42 條件缺損病毒(coditionally defective viruses) 即基因組發(fā)生了突變的病毒條件致死突變體。它們在允許條件下能夠正常繁殖，在非允許條件或稱限制條件下導(dǎo)致流產(chǎn)感染發(fā)生。
43 整合感染(integrated infection) 病毒感染細胞后，因病毒與細胞的性質(zhì)，病毒基因組整合于宿主染色體，并隨細胞分裂傳遞給子代細胞。
44 烈性噬菌體(virulent phage) 感染細菌后，能在細胞內(nèi)正常復(fù)制，并最終殺死細胞的噬菌體。
45 溶源性(lysogeny) 感染細胞后噬菌體不能完成復(fù)制循環(huán)，噬菌體基因組長期存在于宿主細胞內(nèi)，沒有子代噬菌體產(chǎn)生的現(xiàn)象。
46 溫和噬菌體(temperate phage) 能夠?qū)е氯茉葱园l(fā)生的噬菌體，又稱溶源性噬菌體(1ysogenic phage)。
47 原噬菌體(prophage) 整合于細菌染色體或以質(zhì)粒形式存在的溫和噬菌體基因組。
48 溶源性細菌(lysogeniec bacteria) 細胞中含有以原噬菌體狀態(tài)存在的溫和噬菌體基因組的細菌。
49 自發(fā)裂解(spontaneons ysis) 自然情況下的溶源性細菌的裂解，但裂解量較少。
50 誘發(fā)裂解(inductive ysis) 經(jīng)紫外線、環(huán)氧化合物等理化因子處理，溶源性細菌發(fā)生的大量裂解。
51 殺細胞感染(cytocidal infection) 病毒的感染給細胞造成巨大的影響，最終導(dǎo)致細胞死亡和裂解。與之相反的則為非殺細胞感染。
52 溶源轉(zhuǎn)變(lysogenic conversion) 由原噬菌體引起的溶源性細胞除免疫性外的其他表型改變，包括溶源菌細胞表面性質(zhì)的改變和致病性轉(zhuǎn)變。
53 從外部融合(fusion from without) 病毒以高感染復(fù)數(shù)感染時，由毒粒具細胞融合活性的病毒糖蛋白所引起的細胞間的融合。
54 從內(nèi)部融合(fusion from within) 因受染細胞內(nèi)表達的具細胞融合活性的病毒糖蛋白結(jié)合于細胞表面，從而導(dǎo)致的受染細胞與相鄰細胞的融合。
55 半數(shù)致死劑量(50％lethal dose，LDso) 使半數(shù)試驗宿主死亡的病毒劑量。
56 半數(shù)感染劑量(50％binfective dose，IDso) 使半數(shù)試驗宿主發(fā)生感染的病毒劑量。
57 半數(shù)組織培養(yǎng)感染劑量(50％tissue culture infective dose，TCIDso) 使半數(shù)組織培養(yǎng)物發(fā)生感染的病毒劑量。
58 包涵體(inclusionbody) 病毒感染細胞內(nèi)出現(xiàn)的特異性染色區(qū)域。不同病毒所形成的包涵體在細胞質(zhì)和／或細胞核內(nèi)的定位不同；其染色性質(zhì)亦不同，即有的嗜酸性染料，有的嗜堿性染料；并且其大小、形態(tài)和數(shù)量亦有所區(qū)別，所以包涵體在病毒的實驗診斷具有一定的意義。包涵體是病毒復(fù)制所產(chǎn)生的復(fù)制復(fù)合物、轉(zhuǎn)錄復(fù)合物、裝配中間體，所合成的核殼和毒粒累積在宿主細胞的特定區(qū)域內(nèi)而形成的，稱之為病毒工廠的結(jié)構(gòu)。
59 致病性(pathogenicity) 特定的微生物種引起宿主疾病的潛在能力，或致病的狀態(tài)或特性，是病毒種的特征。
60 衛(wèi)星RNA(satellite RNA satRNA) 必須依賴于輔助病毒進行復(fù)制的小分子單鏈RNA片段，它被包裝在其輔助病毒的殼體中，其對于輔助病毒的復(fù)制不是必需的，它們與輔助病毒基因組無明顯的同源性，但其存在往往可影響輔助病毒引起的感染癥狀。
61 類病毒(viroid) 一類低相對分子質(zhì)量侵染性的RNA，它們沒有蛋白質(zhì)外殼，亦無編碼功能，在細胞內(nèi)利用宿主的依賴于DNA的RNA聚合酶Ⅱ進行復(fù)制，大多數(shù)類病毒RNA都呈高度堿基配對區(qū)與單鏈環(huán)狀區(qū)相間排列的桿狀構(gòu)型。
62 朊病毒(prion) 一種蛋白質(zhì)侵染顆粒(proteinaceous infectionus particle，PrP)，系引起哺乳動物的亞急性海綿樣腦病的病原因子。據(jù)認為它們不含任何核酸，而是一種細胞組成型基因表達蛋白PrP‘構(gòu)型發(fā)生改變所產(chǎn)生的同分異構(gòu)體。62 毒力(virulence) 一種有機體(如病毒)致病性的程度或強度，以病例致死率和或侵染宿 主組織并致病的能力表示，是病毒株的特征。
第8章 微生物的遺傳
一、術(shù)語及名詞
1 基因組(genome) 指存在于細胞或病毒中的所有基因，由于現(xiàn)在發(fā)現(xiàn)許多非編碼序列且有重要的功能，因此，目前基因組的含義實際上是指細胞中基因以及非基因的DNA序列組成的總稱，包括編碼蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)基因、調(diào)控序列以及目前功能尚不清楚的DNA序列。
2 擬核 (nucliod) 大腸桿菌的基因組為雙鏈環(huán)狀的DNA分子，在細胞中以緊密纏繞成的較致密的不規(guī)則的小體形式存在于細胞中，該小體稱為擬核。
3 遺傳豐余 (genetic redundancy) 酵母基因組全序列測定完成以后，在其基因組上還發(fā)現(xiàn)了許多較高同源性的DNA重復(fù)序列，稱之為遺傳豐余。
4 質(zhì)粒(plsmid) 細胞中除染色體以外的一類遺傳因子，一種獨立于染色體外，能進行自主復(fù)制的細胞質(zhì)遺傳因子，主要存在于各種微生物細胞中。
5 轉(zhuǎn)座因子(transposable element) 也是細胞中除染色體以外的一類遺傳因子，位于染色體或質(zhì)粒上的一段能改變自身位置的DNA序列，廣泛分布于原核和真核細胞中。
6 質(zhì)粒的不親和性(incompatibility) 如果將一種類型的質(zhì)粒通過接合或其他方式(如轉(zhuǎn)化)導(dǎo)人某一合適的但已含另一種質(zhì)粒的宿主細胞，只經(jīng)少數(shù)幾代后，大多數(shù)子細胞只含有其中一種質(zhì)粒，那么這兩種質(zhì)粒便是不親和的(incompatible)，它們不能共存于同一細胞中。質(zhì)粒的這種特性稱為不親和性(incompatibility)。
7 消除(curing) 所謂消除是指細胞中由于質(zhì)粒的復(fù)制受到抑制而染色體的復(fù)制并未明顯受到影響，細胞可繼續(xù)分裂的情況下發(fā)生的質(zhì)粒丟失。質(zhì)粒消除可自發(fā)產(chǎn)生，也可通過人工處理提高消除率。
8 插入突變(insertion mutation) 當各種IS、Tn等轉(zhuǎn)座因子插入到某一基因中后，此基因的功能喪失，發(fā)生的突變。
9 基因突變(gene mutation) 一個基因內(nèi)部遺傳結(jié)構(gòu)或DNA序列的任何改變，包括一對或少數(shù)幾對堿基的缺失、插入或置換，而導(dǎo)致的遺傳變化稱為基因突變(gene mutation)，其發(fā)生變化的范圍很小，所以又稱點突變(point mutation)或狹義的突變
10 同義突變(same-sense mutation) 這是指某個堿基的變化沒有改變產(chǎn)物氨基酸序列的
密碼子變化，顯然，這是與密碼子的簡并性相關(guān)的。
11 錯義突變(mis-sense mutation) 是指堿基序列的改變引起了產(chǎn)物氨基酸的改變。有些
錯義突變嚴重影響到蛋白質(zhì)活性甚至使之完全無活性，從而影響了表型。如果該基因是必需基因，則該突變?yōu)橹滤劳蛔?lethalmutation)。
12 無義突變(nonsense mutation) 是指某個堿基的改變，使代表某種氨基酸的密碼子變?yōu)榈鞍踪|(zhì)合成的終止密碼子(UAA，UAG，UGA)。蛋白質(zhì)的合成提前終止，產(chǎn)生截短的蛋白質(zhì)。
13 移碼突變(frameshift mutation) 由于DNA序列中發(fā)生1～2個核苷酸的缺失式插入，使翻譯的閱讀框發(fā)生改變，從而導(dǎo)致從改變位置以后的氨基序列的完全變化。
14 表型(phenotype) 是指可觀察或可檢測到的個體性狀或特征，是特定的基因型在一定環(huán)境條件下的表現(xiàn)。
15 基因型(genotype) 是指貯存在遺傳物質(zhì)中的信息，也就是它的DNA堿基順序。上述4種類型的突變，除了同義突變外，其他3種類型都可能導(dǎo)致表型的變化。
16 營養(yǎng)缺陷型(auxotroph) 一種缺乏合成其生存所必須的營養(yǎng)物的突變型，只有從周圍環(huán)境或培養(yǎng)基中獲得這些營養(yǎng)或其前體物(precursor)才能生長。
17 抗藥性突變型(resistantmutant) 由于基因突變使菌株對某種或某幾種藥物，特別是抗生素，產(chǎn)生抗性的一種突變，普遍存在于各類細菌中，也是用來篩選重組子和進行其他遺傳學(xué)研究的重要正選擇標記。這類突變類型常用所抗藥物的前3個小寫斜體英文字母加上“r”表示。
18 條件致死突變型(conditional lethal mutant) 是指在某一條件下具有致死效應(yīng)，而在另一條件下沒有致死效應(yīng)的突變型。這類突變型常被用來分離生長繁殖必需的突變基因。因為這類基因一旦發(fā)生突變是致死的(例如，為DNA復(fù)制所必需的基因)，因而也就不可能得到這些基因的突變。
19 形態(tài)突變型(morphological mutant) 是指造成形態(tài)改變的突變型，包括影響細胞和菌落形態(tài)、顏色以及影響噬菌體的噬菌斑形態(tài)的突變型。
20自發(fā)突變(spontaneous mutation)和誘發(fā)突變(induced mutation)不經(jīng)誘變劑處理而自然發(fā)生的突變稱自發(fā)突變，其突變的頻率是很低的，一般為10—6～10—l”。許多化學(xué)、物理和生物因子能夠提高其突變頻率，將這些能使突變率提高到自發(fā)突變水平以上的物理、化學(xué)和生物因子稱為誘變劑(mutagen)。所謂誘發(fā)突變并非是用誘變劑產(chǎn)生新的突變，而是通過不同的方式提高突變率。
21Ames試驗 現(xiàn)已發(fā)現(xiàn)許多化學(xué)誘變劑能夠引起動物和人的癌癥，因此，利用細菌突變來檢測環(huán)境中存在的致癌物質(zhì)是一種簡便、快速、靈敏的方法。該方法是由美國加利福尼亞大學(xué)的Ames教授首先發(fā)明，故又稱Ames試驗。
22 回復(fù)突變(reverse mutation back mutation) 指突變體失去的野生型性狀，可以通過第二次突變得到恢復(fù)，這種第二次突變稱為回復(fù)突變。
23 光復(fù)活作用(photo reactivation) 光解酶在黑暗中專一地識別嘧啶二聚體并與之結(jié)合，形成酶—DNA復(fù)合物，當給予光照時，酶利用光能將二聚體拆開，恢復(fù)原狀，使DNA損傷得到修復(fù)。
24 切除修復(fù)(excision repair) 又稱暗修復(fù)。是細胞內(nèi)的主要修復(fù)系統(tǒng)，通過UvrA、B、C、D4種蛋白質(zhì)的聯(lián)合作用切除DNA損傷，留下的單鏈缺口由DNA聚合酶I和連接酶修復(fù)。
25 重組修復(fù)(recombination repair) 這是一種越過損傷而進行的修復(fù)。是通過復(fù)制后，經(jīng)染色體交換，使子鏈上的空隙部位面對正常的單鏈，再通過DNA聚合酶和連接酶修復(fù)空隙部分。
26 SOS修復(fù)(SOS repair) DNA受到廣泛損傷時發(fā)生的復(fù)雜誘導(dǎo)型應(yīng)急修復(fù)過程。
27 接合作用(conjugation) 是指通過細胞與細胞的直接接觸而產(chǎn)生的遺傳信息的轉(zhuǎn)移和重組過程。
28 轉(zhuǎn)導(dǎo)(transduction) 是由病毒介導(dǎo)的細胞間進行遺傳交換的一種方式。其具體含義是指一個細胞的DNA或RNA通過病毒載體的感染轉(zhuǎn)移到另一個細胞中。
29 普遍性轉(zhuǎn)導(dǎo)(generalized transduction) 噬菌體可以轉(zhuǎn)導(dǎo)給體染色體的任何部分到受體細胞中。
30 局限性轉(zhuǎn)導(dǎo)(specialized transduction) 噬菌體總是攜帶同樣的片段到受體細胞中。
31 遺傳轉(zhuǎn)化(genetic transformation) 是指同源或異源的游離DNA分子(質(zhì)粒和染色體DNA)被自然或人工感受態(tài)細胞攝取，并得到表達的水平方向的基因轉(zhuǎn)移過程。
32 感受態(tài)(competence) 能從周圍環(huán)境中吸取DNA的一種生理狀態(tài)。
33 中斷雜交(interrupted mating)技術(shù) 此技術(shù)的基本要點是把接合中的細菌在不同時間取樣，并把樣品猛烈攪拌以分散接合中的細菌，然后分析受體細菌基因型，以時間(分·鐘)為單位繪制遺傳圖譜。
34 酵母菌的2μm質(zhì)粒(2μmplasmid) 是封閉環(huán)狀的雙鏈DNA分子，周長約21xm(6kb左右)，是酵母菌中進行分子克隆和基因工程的重要載體，因此，以它為基礎(chǔ)進行改建的克隆和表達載體己得到廣泛的應(yīng)用。
35 準性生殖(parasexual reproduction) 是指不經(jīng)過減數(shù)分裂就能導(dǎo)致基因重組的生殖過程。在該過程中染色體的交換和染色體的減少不像有性生殖那樣有規(guī)律，而且也是不協(xié)調(diào)的。
36 誘變育種(mutation breeding) 是指利用各種誘變劑處理微生物細胞，提高基因的隨機突變頻率，通過一定的篩選方法(或特定的篩子)獲得所需要的高產(chǎn)優(yōu)質(zhì)菌株。
37 抗阻遏和抗反饋突變型(repression resistantand~edbackresistantmutants) 突變型都是由于代謝失調(diào)所造成的，它們都有共同的表型，即在細胞中已經(jīng)有大量最終代謝產(chǎn)物時仍然繼續(xù)不斷地合成這一產(chǎn)物。只是前者為調(diào)節(jié)基因發(fā)生了突變；后者是由于變構(gòu)酶基因發(fā)生了突變。
38 原生質(zhì)體融合(protoplast fusion) 是將遺傳性狀不同的兩種菌(包括種間、種內(nèi)及屬間)融合為一個新細胞的技術(shù)。主要包括原生質(zhì)體的制備、原生質(zhì)體的融合、原生質(zhì)體再生和融合子選擇等步驟。
39 電融合技術(shù)(electro fusion) 是一項有效促成原生質(zhì)體融合的手段。融合過程首先是原生質(zhì)體在電場中極化成偶極子，并沿電力線方向排列成串，然后，在加直流脈沖后，原生質(zhì)體膜被擊穿，從而導(dǎo)致融合的發(fā)生。
40DNA Shuffling1994年美國的Stemmer提出的一個全新的人工分子進化技術(shù)，該技術(shù)能模擬生物在數(shù)百萬年間發(fā)生的分子進化過程，并可在短的實驗循環(huán)中定向篩選出特定基因編碼的酶蛋白活性提高幾百倍甚至上千倍的功能性突變基因。
第十三章 微生物物種的多樣性
一、名詞及術(shù)語
1 假菌絲(pseudohypha) 酵母菌在玉米粉培養(yǎng)基上出芽生殖后的細胞連成絲狀群體，有別于真菌的菌絲體。
2 蕈菌(mushrooms) 大型真菌，俗稱蘑菇，很多種味美可食。
3 子實體(fruiting bodies) 在真菌學(xué)中稱為擔(dān)子果，是高等擔(dān)子菌子實層的一種高度組織化結(jié)構(gòu)，具有多種多樣的形狀。
4 黏菌(slime molds) 非光合作用、無細胞壁、產(chǎn)子實體結(jié)構(gòu)(細胞黏菌)或者為原質(zhì)團(非細胞黏菌)的真核生物。
5 原質(zhì)團(plasmadia) 亦稱變形體，是非細胞黏菌大小和形狀不固定的營養(yǎng)體。
6 假原質(zhì)團(pseudoplasmodium) 由饑餓狀態(tài)的細胞黏菌聚集后所形成的結(jié)構(gòu)。
7 變形蟲方式運動(ameboid movement) 原生動物以細胞質(zhì)流動進行移動的一種運動方式。
第十四章 感染與免疫
一、術(shù)語或名詞
1 病原微生物(pathogenic microorganism) 寄生于生物(包括人)機體并引起疾病的微生物，又稱病原體(pathogen)。
2 條件致病菌(opportunistic pathogen) 在一般情況下不致病，但在某些條件改變的特殊情況下亦可致病的細菌，又稱機會致病菌。
3 免疫(immunity) 生物體能夠辨認自我與非自我，對非我做出反應(yīng)以保持自身穩(wěn)定的功能，稱為免疫。
4 非特異性免疫(non-specificimmunity) 機體在種系發(fā)育過程中由遺傳得來的一般生理防衛(wèi)功能，可抵御任何外界異物對機體的侵入而不需要特殊的刺激或誘導(dǎo)。又稱天然免疫(innate immunity)。
5 補體(complement system) 存在于機體正常血清中的一組多分子蛋白系統(tǒng)，通常處于不活化或微量活化狀態(tài)，一旦活化后具有溶解靶細胞等重要的免疫生理學(xué)作用。
6 經(jīng)典途徑(classical pathway，CP) 由抗原抗體復(fù)合物結(jié)合于補體成分C1上，自C1到C9依次活化的補體激活途徑稱經(jīng)典途徑。
7 替代途徑(alternative pathway，AP) 由酵母多糖、LPS等多種微生物及其產(chǎn)物從C3和B因子開始激活的途徑稱補體激活的替代途徑，又稱旁路途徑。
8 凝集素途徑(lectin pathway) 由急性期蛋白與病原體結(jié)合從C2和C4開始的補體激活途徑稱凝集素途徑。
9 干擾素(interferon，IFN) 宿主細胞在病毒等多種誘生劑刺激下產(chǎn)生的一組低分子糖蛋白，具有抗病毒及免疫調(diào)節(jié)作用。
10 吞噬細胞(phagocyte) 具有吞噬病原微生物、衰老細胞等各種異物顆粒并能將其消化降解的細胞稱為吞噬細胞，又分為大、小吞噬細胞兩類。大吞噬細胞指巨噬細胞(microphage)，小吞噬細胞指中性粒細胞(neutrophilic granulocyte)，又稱多形核白細胞(polymorphonuclearleucocyte，PMN)。
11 自然殺傷細胞(natural killer cell，NK) 一類不須事先致敏也不須其他輔助細胞或分子參與而能直接殺傷靶細胞的非T非B淋巴細胞。
12 炎癥(infiammatory) 機體受到有害刺激時所表現(xiàn)的全身性防御應(yīng)答，其作用為清除有害異物，修復(fù)受傷組織、保持自身穩(wěn)定性。
13 免疫應(yīng)答(immune response，IR) 免疫細胞對抗原分子的識別、活化、分化和效應(yīng)過程。
14 特異性免疫(spesific immunity) 機體在生命過程中接受抗原性異物刺激后產(chǎn)生的針對性排除、摧毀、滅活相關(guān)抗原的防御能力，又稱獲得性免疫(acquired immunity)。
15 免疫系統(tǒng)(immune system) 由免疫器官、免疫細胞和免疫分子組成，是獲得性免疫的物質(zhì)基礎(chǔ)。
16 中樞免疫器官(centralimmuneorgan) 是免疫細胞發(fā)生和分化的場所，包括骨髓、胸腺和鳥類的法氏囊。
17 周圍免疫器官(peripheralimmune organ) 是免疫細胞居住和發(fā)生免疫應(yīng)答的場所，包括淋巴結(jié)、脾臟和黏膜相關(guān)淋巴組織。
18 免疫細胞(immunocye) 參與免疫應(yīng)答或與免疫應(yīng)答有關(guān)的細胞，主要包括淋巴細胞、粒細胞和肥大細胞、單核巨噬細胞、樹突狀細胞，廣義地還包括紅細胞和血小板及上述各類細胞的祖細胞。
19 淋巴細胞(Umphocyte) 廣泛存在于免疫組織，淋巴液和血液的一類免疫細胞，按照表面分子標志及功能分為T細胞、B細胞和第三類(非T非B)淋巴細胞。
20 抗原(antigen，Ag) 能誘導(dǎo)機體產(chǎn)生體液抗體和細胞免疫應(yīng)答，并能與抗體和致敏淋巴細胞在體內(nèi)外發(fā)生特異結(jié)合反應(yīng)的物質(zhì)。
21 免疫原性(immunogenicity) 抗原在體內(nèi)激活免疫系統(tǒng)，使其產(chǎn)生抗體和特異效應(yīng)細胞的特性。
22 免疫反應(yīng)性(immunoreactivity) 抗原能與相對應(yīng)的免疫應(yīng)答產(chǎn)物(抗體及致敏淋巴細胞)發(fā)生特異結(jié)合反應(yīng)的能力，又稱反應(yīng)原性(reactinogenicity)。
23 免疫原(imunogen) 具有免疫原性和反應(yīng)原性的抗原，又稱完全抗原(complete antigen)。
24 半抗原(hapten) 只有反應(yīng)原性而沒有免疫原性的抗原，又稱不完全抗原(incomplete antigen)。
25 抗原決定簇(antigen determinant) 抗原物質(zhì)上能夠刺激淋巴細胞產(chǎn)生應(yīng)答并與其產(chǎn)物特異反應(yīng)的化學(xué)基因，又稱表位epitope。
26 主要組織相容性復(fù)合體(major histocompatibility complex，MHC) 一組極其多態(tài)的基因，編碼MHCI類抗原和MHCⅡ類抗原以及一些其他分子。MHC抗原是機體的自身標志性分子，參與T細胞對抗原的識別及免疫應(yīng)答中各類免疫細胞間的相互作用，也限制NK細胞不會誤傷自身組織，是機體免疫系統(tǒng)區(qū)分自己與非己的主要分子基礎(chǔ)。
27 白細胞分化抗原(cluster of differentiation，CD) 是各類白細胞在發(fā)育分化過程中表達的表面分子，有的在不同階段出現(xiàn)或消失，有的持續(xù)終生。CDs具有各自不同的多種功能。
28 抗體(antibody Ab) 機體在抗原物質(zhì)刺激下所形成的一類能與抗原特異結(jié)合的血清活性成分，又稱免疫球蛋白(immunoglobulin，Ig)。
29 B淋巴細胞(Blymphocyte) 在骨髓中發(fā)育成熟的淋巴細胞，當受抗原刺激時產(chǎn)生抗體。簡稱B細胞。
30 體液免疫(humoralimmunity，H1) 由B淋巴細胞分泌抗體介導(dǎo)的免疫稱體液免疫。
31 胸腺依賴性抗原(thymus dependent antigen TDAg) 當刺激機體B細胞產(chǎn)生抗體時需要T細胞輔助的抗原。絕大多數(shù)天然抗原屬于TD抗原。
32 胸腺非依賴性抗原(thymus independent antigen TIAg) 當刺激機體B細胞產(chǎn)生抗體時不需要T細胞輔助的抗原。通常是有多個重復(fù)相同的抗原決定簇。
33 調(diào)理作用(opsonization) 病原微生物等顆�？乖c抗體(1gG)或補體片段(C3b)結(jié)合后易被吞噬細胞吞噬的現(xiàn)象稱為抗體或補體的調(diào)理作用。
34 抗體依賴性細胞介導(dǎo)的細胞毒作用(antibody dependent cell—mediated cytotoxicity，ADCC) 抗體分子Fc片段與巨噬細胞、NK細胞表面相應(yīng)受體結(jié)合后介導(dǎo)此細胞對該抗體分子包被靶細胞的殺傷，稱抗體的ADCC作用。
35 B細胞抗原受體復(fù)合體(B-cellantigen receptor complex) BCRC由B細胞膜表面IgM和IgD與CD79異源二聚體組成，其中mlg是特異性抗原受體，CD79是向胞內(nèi)傳遞活化信號的信號傳遞單位。
36 T淋巴細胞(T lymphocyte) 經(jīng)過胸腺發(fā)育成熟的淋巴細胞，經(jīng)抗原刺激后介導(dǎo)細胞免疫。簡稱T細胞。
37 T細胞抗原受體復(fù)合體(T-cell antigen receptor complex，TCRC) 由T細胞膜表面特異性抗原受體TCR與CD3分子組成，其中TCR是特異性抗原受體，CD3是向胞內(nèi)傳遞激活信號的信號傳遞單位。
38 細胞免疫(cell mediated immunity，CMl) 由活化T細胞產(chǎn)生的特異殺傷或免疫炎癥。
39 抗原提呈細胞(Ag presenting cell，APC) 具有攝取、加工、提呈抗原給T細胞的能力的細胞稱為抗原提呈細胞，又稱輔助細胞(accessory cell)，主要包括樹突狀細胞、單核巨噬細胞和B細胞。
40 超抗原(superantigen，SAg) 不需經(jīng)過加工提呈即可被T細胞識別的抗原。
41 MHC限制性(MHC restriction) T細胞通過其抗原受體TCR識別抗原的同時也識別與其結(jié)合的MHC分子，稱為免疫應(yīng)答的MHC限制性。
42。輔助性T細胞(helper T lymphocyte，T11) 表面標志為CD4’的T淋巴細胞亞群，在抗原刺激下分泌多種細胞因子促進免疫應(yīng)答，對B細胞產(chǎn)生抗體及細胞毒T細胞的殺傷起輔助作用。
43 細胞毒性T細胞(cytotoxic T lymphocyte，CTL) 表面標志為CD8’的T淋巴細胞亞群，具有殺傷靶細胞的功能。
44 超敏反應(yīng)(hypersensitivity) 免疫應(yīng)答反應(yīng)過強或反應(yīng)異常造成機體損傷或功能障礙。
45 自身免疫(autoimmunity) 當某些情況下機體免疫系統(tǒng)對自身成分產(chǎn)生免疫應(yīng)答如產(chǎn)生自身抗體時，稱為自身免疫。
46 自身免疫病(autoimmune disease) 當自身免疫達到一定強度而造成病理性損害時稱自身免疫病。
47 宿主抗移植物反應(yīng)(host versus graft reaction，HVGR) 在無關(guān)個體間進行器官移植時，受者將移植器官當作異物產(chǎn)生免疫應(yīng)答而進行殺傷清除，稱宿主抗移植物反應(yīng)，是當前器官移植的主要問題。
48 移植物抗宿主反應(yīng)(graft versus host reaction，GVHR) 當用含有免疫活性細胞的組織(骨髓、胸腺、胚肝等)植入有免疫缺陷的受體時，移植物不遭排斥但對宿主產(chǎn)生免疫損傷，稱移植物抗宿主反應(yīng)，往往是嚴重而致命的。
49 免疫缺陷(immunodeficiency) 機體免疫系統(tǒng)發(fā)育異�；蚬δ苷系K，造成免疫功能不全或缺失，稱為免疫缺陷。依照其病原又分為原發(fā)性和繼發(fā)性兩大類。
50 獲得性免疫缺陷綜合征(acquired deficiency syndrome，AIDS) 由人類免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus，HIV)感染引起的繼發(fā)性免疫缺陷，是一種機體免疫系統(tǒng)功能全面下降的嚴重疾病。
51 腫瘤特異性抗原(tumor specific antigen，TSA) 指僅存在于某類腫瘤細胞而不存在于正常細胞或其他腫瘤細胞的抗原。
52 腫瘤相關(guān)抗原(tumor-associated antigen，TAA) 指腫瘤細胞表面含量明顯高于正常細胞的抗原，只有相對特異性。如胚胎性抗原，病毒相關(guān)抗原等。
53 淋巴因子活化的殺傷細胞(lymphokine activated killer cell，LAK) 一些原來不表現(xiàn)殺傷功能的淋巴細胞與白細胞介素2(1L—2)共同培養(yǎng)時，可誘導(dǎo)出殺細胞活性，稱為淋巴因子活化的殺傷細胞。
54 抗血清(antiserum) 經(jīng)人工接種抗原或疾病后含有大量特異性抗體的動物或人血清，稱抗血清，又稱免疫血清。
55 單克隆抗體(monoclonal antibody) 由單個B細胞增殖所產(chǎn)生的抗體，其遺傳背景完全一致，因此，抗體分子的氨基酸序列、類型、抗原特異性等生物學(xué)性狀均相同。
56 凝集反應(yīng)(agglutination) 顆粒性抗原與相應(yīng)抗體在適量電解質(zhì)環(huán)境中相互作用，經(jīng)過一定時間出現(xiàn)肉眼可見凝集現(xiàn)象，稱凝集反應(yīng)。
57 沉淀反應(yīng)(precipitation reaction) 可溶性抗原與相應(yīng)抗體在電解質(zhì)存在的適當條件下相遇，經(jīng)過一定時間出現(xiàn)肉眼可見的沉淀現(xiàn)象，稱沉淀反應(yīng)。
58 免疫熒光技術(shù)(immunofluorescence technic) 是一種將免疫反應(yīng)的特異性與熒光標記分子的可見性結(jié)合起來的方法，因常用熒光物質(zhì)標記抗體，又稱熒光抗體法。
59 放射免疫測定(radioimmunoassay，RIA) 是一種以放射性同位素作為標記物，將同位素分析的靈敏性和抗原抗體反應(yīng)的特異性這兩大特點結(jié)合起來的測定技術(shù)。
60 免疫酶技術(shù)(Immunoenzyme Techniques) 以酶為標記物，于抗原抗體反應(yīng)后在相應(yīng)酶底物作用下產(chǎn)生可見的不溶性有色產(chǎn)物而進行測定的方法。
61 酶聯(lián)免疫吸附測定(enzyme linked immunosorbent assay，ELISA) 將可溶性抗體或抗原吸附到聚苯乙烯等固相載體上進行免疫酶反應(yīng)的定性定量方法。
62 免疫印跡(immunoblot) 蛋白質(zhì)樣品經(jīng)聚丙烯酰胺凝膠電泳分離后轉(zhuǎn)移到硝酸纖維膜上，然后用標記抗體揭示特異抗原存在的分析測定方法。
63 人工免疫(artificial immunization) 人為地給機體輸入抗原以調(diào)動機體的免疫系統(tǒng)或直接輸入免疫細胞及分子，使獲得某種特殊抵抗力用以預(yù)防或治療某些疾病的方法稱為人工免疫。
64 人工自動免疫(artificalactive immunization) 給機體輸入抗原物質(zhì)，使免疫系統(tǒng)因抗原刺激而發(fā)生類似感染時所發(fā)生的應(yīng)答過程，從而產(chǎn)生特異免疫力，稱人工自動免疫，又稱預(yù)防接種。
