同型不親和性的一種類型，亦稱為整體不親和性。有關(guān)花粉親和性的性質(zhì)，是受產(chǎn)生花粉的孢子體基因型的影響，在柱頭上由于花粉的發(fā)芽受到抑制而產(chǎn)生了不親和性。這是由于孢子體中已經(jīng)產(chǎn)生的物質(zhì)通過細(xì)胞質(zhì)而影響配子（花粉）的結(jié)果。例如把產(chǎn)生花粉的親本的不親和性基因的基因型記為S₁S₂，把特有雌蕊的基因型記為S₁S₃，不論花粉的基因型是S₁還是S₂，在S₁S₃基因型的柱頭上花粉的發(fā)芽總是受到抑制。這樣，花粉所表現(xiàn)的性質(zhì)是由形成花粉的親本基因型也就是孢子體的基因型來決定的；這種現(xiàn)象稱為孢子體不親和性。已知在菊科、十字花科等植物中有這種現(xiàn)象。