體外轉(zhuǎn)錄合成siRNAs，其成本相對化學(xué)合成法比較低，是一種相對性價比高的篩選siRNAs的好方法，而且要比化學(xué)合成法更快的得到siRNAs。一旦得到DNA 雙鏈模版（這個還是需要DNA合成的，不過DNA合成的成本就比較低了），只要24小時轉(zhuǎn)染，不需要等很久。在體外構(gòu)建雙鏈RNA時，分別在體外轉(zhuǎn)錄出正義和反義RNA，再將兩者退火，形成雙鏈RNA。體外合成的雙鏈RNA可以用脂質(zhì)體轉(zhuǎn)入細(xì)胞中。但有些細(xì)胞脂質(zhì)體轉(zhuǎn)移效果差，轉(zhuǎn)移到細(xì)胞內(nèi)的雙鏈RNA半衰期短。

這個方法的不足之處是實驗的規(guī)模受到限制，雖然一次體外轉(zhuǎn)錄合成能提供足夠做數(shù)百次轉(zhuǎn)染的siRNAs，但是反應(yīng)規(guī)模和數(shù)量始終有一定的限制。而且和化學(xué)合成相比，還是需要占用研究人員相當(dāng)?shù)臅r間——化學(xué)合成只需要定購就可以了。但體外轉(zhuǎn)錄得到的siRNAs只要較低的濃度就可以達(dá)到化學(xué)合成siRNAs較高濃度得到的效果。

適用：篩選siRNAs，特別是需要制備多種siRNAs，試驗經(jīng)費受限時。
不適用：1.需要大量的某個特定的siRNA。2.進(jìn)行長期研究。