1.菌株管理及相關(guān)概念
標(biāo)準(zhǔn)菌株:即0代菌種,是指從官方菌種保藏機構(gòu)獲得并至少定義到屬或種的水平的菌株。實驗室的標(biāo)準(zhǔn)菌株應(yīng)有明確來源。
標(biāo)準(zhǔn)儲備菌株:從國內(nèi)或國外菌種保藏機構(gòu)獲得的標(biāo)準(zhǔn)菌株經(jīng)過復(fù)活并在適宜的培養(yǎng)基中生長后,即為標(biāo)準(zhǔn)貯備菌株。
儲存菌株:儲存菌株通常從凍干或超低溫保存的標(biāo)準(zhǔn)儲存菌株進行制備。
工作菌株:標(biāo)準(zhǔn)儲備菌株或儲存菌株經(jīng)繼代培養(yǎng)后得到的菌株。工作菌株不可替代標(biāo)準(zhǔn)菌株。
標(biāo)準(zhǔn)培養(yǎng)物:標(biāo)準(zhǔn)菌株、標(biāo)準(zhǔn)儲備菌株、工作菌株的統(tǒng)稱。
商業(yè)派生菌株:即用型與標(biāo)準(zhǔn)菌株所有相關(guān)特性等效的可以溯源的商業(yè)衍生物。常見的有定量工作菌株。
2.標(biāo)準(zhǔn)菌株的獲取
藥品微生物檢驗用的試驗菌應(yīng)為有明確來源的標(biāo)準(zhǔn)菌株,或使用與標(biāo)準(zhǔn)菌株所有相關(guān)特性等效的可以溯源的商業(yè)派生菌株。
標(biāo)準(zhǔn)菌株應(yīng)來自認(rèn)可的國內(nèi)或國外菌種保藏機構(gòu)。中國藥典2020版以及國標(biāo)中涉及的菌株主要來自于兩大菌種保藏中心:中國醫(yī)學(xué)細菌保藏管理中心(CMCC)、美國標(biāo)準(zhǔn)菌種保藏中心(ATCC)。
菌株購買前需根據(jù)實驗室檢測需求制定采購計劃,經(jīng)審批后,向認(rèn)可的國內(nèi)或國外的菌種保藏機構(gòu)購買標(biāo)準(zhǔn)菌株。標(biāo)準(zhǔn)菌株到達實驗室后,菌種管理人應(yīng)檢查其名稱、數(shù)量以及每一支的完整性,同時將菌種的所有信息填寫記錄(包括菌種名稱、編號、數(shù)量、代數(shù)、來源、接收日期、接收人等),并將其貯存在規(guī)定溫度的冰箱里。
3.標(biāo)準(zhǔn)菌株的復(fù)蘇、復(fù)壯和保存
標(biāo)準(zhǔn)菌株的復(fù)蘇、復(fù)壯或培養(yǎng)物的制備應(yīng)按供應(yīng)商提供的說明或按已驗證的方法進行。復(fù)蘇、復(fù)壯應(yīng)選擇營養(yǎng)成分豐富且全面的培養(yǎng)基(例如:TSA/TSB/NA/NB/SDB/SDA等),一般不使用選擇性較強的培養(yǎng)基;特殊的一些菌株在普通的培養(yǎng)基上生長不好,可能還需添加生長因子。
標(biāo)準(zhǔn)儲備菌株應(yīng)進行純度和特性確認(rèn)。純度確認(rèn)包括:平板劃線查看菌落形態(tài)、革蘭氏染色、顯微鏡觀察菌體形態(tài)等;關(guān)鍵特性確認(rèn)可選擇:特征生化反應(yīng)確認(rèn)、試劑盒鑒定、菌種鑒定儀鑒定等。需要注意的是,從開啟、復(fù)蘇、復(fù)壯到純度和特性的確認(rèn),都應(yīng)做好實驗記錄。
標(biāo)準(zhǔn)儲備菌株保存時,可將培養(yǎng)物等份懸浮于抗冷凍的培養(yǎng)基中,并分裝于小瓶中,藥典建議采用低溫冷凍干燥、液氮貯存、超低溫冷凍(低于-30℃)等方法保存。低于-70℃或低溫冷凍干燥方法可以延長菌種保存時間。菌種應(yīng)設(shè)專人管理,菌種保藏的地點應(yīng)采取一定的措施使非管理者不能輕易獲取,例如加鎖保管,雙人保管等。
標(biāo)準(zhǔn)儲備菌株可用于制備每月或每周1次轉(zhuǎn)種的工作菌株。冷凍菌種一旦解凍轉(zhuǎn)種制備工作菌株后,不得重新冷凍和再次使用。
從保藏機構(gòu)獲取的凍干菌種為0代菌種,每轉(zhuǎn)接一次增加一代(1代是指將活的培養(yǎng)物接種到微生物生長的新鮮培養(yǎng)基中培養(yǎng),任何形式的轉(zhuǎn)種均被認(rèn)為傳代一次),工作菌株的傳代次數(shù)應(yīng)嚴(yán)格控制,不得超過5代,以防止過度的傳代增加菌株變異的風(fēng)險。
4.工作菌株的制備
工作菌株由儲存菌株或標(biāo)準(zhǔn)貯備菌株制備,除此之外,還可以使用可以溯源的商業(yè)派生菌株。標(biāo)準(zhǔn)菌株如果經(jīng)過確認(rèn)試驗證明已經(jīng)老化、退化、變異、污染等或該菌株已無使用需要時,應(yīng)及時滅菌銷毀。
5.實驗室菌株管理
菌種必須定期轉(zhuǎn)種傳代,并做純度、特性等實驗室所需關(guān)鍵指標(biāo)的確認(rèn),實驗室應(yīng)建立菌種管理(從標(biāo)準(zhǔn)菌株到工作菌株)的文件和記錄,內(nèi)容包括菌株的申購、進出、收集、貯藏、確認(rèn)、轉(zhuǎn)種、使用以及銷毀等全過程。每支菌種都應(yīng)注明其名稱、標(biāo)準(zhǔn)號、接種日期、傳代數(shù),并記錄菌種生長的培養(yǎng)基和培養(yǎng)條件、菌種保藏的位置和條件等信息。
有關(guān)微生物實驗室菌株管理及使用涉及的相關(guān)法規(guī)如下,可供參考:
中國藥典2020版《9203藥品微生物實驗室質(zhì)量管理指導(dǎo)原則》
中國藥典2020版《9204微生物鑒定指導(dǎo)原則》
中國藥典2020版《9205藥品潔凈實驗室微生物監(jiān)控和控制指導(dǎo)原則》
藥品生產(chǎn)質(zhì)量管理規(guī)范(2010年修訂)
CNAS-CL03-A001-2019《能力驗證提供者認(rèn)可準(zhǔn)則在微生物領(lǐng)域的應(yīng)用說明》
CNAS-CL05-2009《實驗室生物安全認(rèn)可準(zhǔn)則》
GB 4789.28-2013食品安全國家標(biāo)準(zhǔn) 食品微生物學(xué)檢驗培養(yǎng)基和試劑的質(zhì)量要求
GB/T 27405-2008 《實驗室質(zhì)量控制規(guī)范食品微生物檢測》
GB 4789.1-2016 食品安全國家標(biāo)準(zhǔn)食品微生物學(xué)檢驗 總則
SN/T 1538.1-2016 培養(yǎng)基制備指南 第1部分 實驗室培養(yǎng)基制備質(zhì)量保證通則
SN/T 1538.2-2016 培養(yǎng)基制備指南 第2部分 培養(yǎng)基性能測試實用指南
SN/T 2660-2010 食品微生物實驗室菌種保藏方法
6.商業(yè)派生菌株
商業(yè)派生菌株是標(biāo)準(zhǔn)菌株的商業(yè)衍生物,最常見的是定量工作菌株。在中國藥典2015版9203指導(dǎo)原則里面有提到“藥品微生物檢驗用的試驗菌應(yīng)來自認(rèn)可的國內(nèi)或國外菌種保藏機構(gòu)的標(biāo)準(zhǔn)菌株,或使用與標(biāo)準(zhǔn)菌株所有相關(guān)特性等效的可以溯源的商業(yè)派生菌株”,USP<1117>也有關(guān)于可以使用合格的商品化菌株的描述“Cultures for use in compendial tests should be acquired from a national culture collection or a qualified secondary supplier”。隨著技術(shù)的進步與發(fā)展,微生物實驗室穩(wěn)定、高效的需求,用于質(zhì)控的商業(yè)化定量工作菌株的廣泛應(yīng)用定是必然趨勢。(現(xiàn)以最新標(biāo)準(zhǔn)為準(zhǔn))
商業(yè)派生菌株要求相關(guān)特性與標(biāo)準(zhǔn)菌株等效,除此之外,還有關(guān)鍵一點就是“可以溯源”。微生物"溯源"通常包含兩層意思,一是指程序、途徑合法有序,來源和去向清晰可控;另外是技術(shù)層面的佐證,比如株水平的鑒定識別等。這兩個層面互為補充支撐,以保證菌種準(zhǔn)確無誤、合法有效。
選擇使用商業(yè)派生菌株時,建議做好實驗室檢測結(jié)果與標(biāo)準(zhǔn)菌株的差異分析和風(fēng)險評估。綜合評估之后,選擇合適的商業(yè)派生菌株。