目前在DNA水平上的分子檢測方法越來越多,其檢測方法快速方便、靈敏、省時被廣泛應用到物種檢測中。其中實時熒光定量聚合酶鏈式反應(PCR)技術因其高特異性、高靈敏度、無污染等優(yōu)點,在食品檢測中備受青睞。上海市質量監(jiān)督檢驗技術研究院,國家食品質量監(jiān)督檢驗中心(上海)的張娜娜、劉 洋*、俞 漪等人建立基于嗜酸乳桿菌SPIDR保守區(qū)域的序列結合實時熒光定量PCR方法定量檢測飲料中的嗜酸乳桿菌,以保障食品安全監(jiān)管順利進行。
1.實時熒光定量PCR方法的特異性
所有嗜酸乳桿菌的標準菌株均有明顯擴增,且Ct值在16~18之間,其他菌株均無明顯的擴增;采用乳桿菌通用引物對所有菌株進行擴增時,可見到清晰的擴增條目。證明本研究建立的實時熒光定量PCR檢測方法對于嗜酸乳桿菌有較好的特異性。
2.檢測方法的靈敏度
①實時熒光定量PCR方法的絕對靈敏度
嗜酸乳桿菌ATCC4356、CICC6082、NCFM、La-14可穩(wěn)定檢測的最低質量濃度為0.00058ng/μL。每個模板添加4μL,即檢測限在3pg左右,本研究的實時熒光定量PCR體系的絕對靈敏度達到3pg。
②實時熒光定量PCR的相對靈敏度
嗜酸乳桿菌ATCC4356的絕對靈敏度可穩(wěn)定檢出的最低濃度為103 CFU/mL。根據(jù)絕對靈敏度和相對靈敏度的檢測可得出實時熒光定量PCR的檢測限為103CFU/mL。
3.實時熒光定量PCR方法的重復性檢測結果
嗜酸乳桿菌ATCC4356不同的核酸濃度擴增,每個質量濃度6個平行,最終實驗結果Ct值的SD介于0.14~0.56之間,RSD介于0.862%~2.55%之間,均在可接受范圍內(nèi)。證明建立的實時熒光定量PCR方法重復性較好。
4.實時熒光定量PCR方法的抗干擾能力
在樣品中混入103、106CFU/mL的雜菌對實時熒光定量PCR的擴增是沒有干擾的,且檢出限仍為103CFU/mL;在不同濃度的嗜酸乳桿菌ATCC4356的核酸中添加300pg/μL、3 ng/μL、30 ng/μL的大腸桿菌ATCC25922的核酸提取物,各濃度梯度核酸檢出的Ct值均未受影響,證明建立的實時熒光定量PCR擴增體系抗干擾能力強。
5.模擬樣品的檢測及標準曲
為驗證建立的方法是否可以在實際樣品中進行檢測,在進行實樣檢測之前,利用模擬樣品對該方法進行驗證。這樣不僅可以節(jié)約時間,且節(jié)省成本在不含嗜酸乳桿菌的乳酸菌飲料為基質的模擬樣品檢測中,以Ct值為縱坐標,以嗜酸乳桿菌標準株已知的不同稀釋菌數(shù)對數(shù)Lg(CFU/g)為橫坐標建立標準曲線,得出線性方程為y=-3.312 4x+38.939,
R2=0.987,檢測結果的線性較好且檢測限仍為103CFU/mL。
6.實際樣品檢測結果
11份樣品中,6份樣品檢測出含有嗜酸乳桿菌,編號分別為B1、B4、B6、B7、B8、B9,這與購買樣品的便簽信息一致。檢測結果可以看出,嗜酸乳桿菌的含量在5.83×102~3.68×104 CFU/mL之間,建立的實時熒光定量PCR方法可以用砸乳酸菌飲料中對嗜酸乳桿菌進行定量。
討論與結論
本研究利用設計的嗜酸乳桿菌屬的特異性引物建立實時熒光定量PCR方法在乳酸菌飲料中的檢測應用。結果證明,該方法的特異性好,檢測限低,純基因水平檢測限在3pg左右,絕對靈敏度檢測達到103CFU/mL,且重復性較好;在純基因水平與培養(yǎng)物水平的抗干擾能力都很強;模擬樣品檢測中其檢測限未改變,重復性較好,證明適合在市場檢測中使用;實際樣品檢測結果與標簽信息一致。并得出嗜酸乳桿菌相應的添加量,只是嗜酸乳桿菌的含量有所不同。這一研究證明該方法可應用在乳酸菌飲料中嗜酸乳桿菌的快速檢測。